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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】Amber断电后怎样接着MD运算啊！
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小虫虫888

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助】Amber断电后怎样接着MD运算啊！

我的MD过程突然断电，已经计算了4ns了，怎样接着计算啊，

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:30 ]
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1楼 2009-08-12 15:20:02
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fantastic

银虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-13 09:03
你计算的4ns是一步计算的呢，还是分段计算的啊？分段计算的接上就好了
要是一步计算的话，我还没有处理过。不过建议还是分段跑
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2楼2009-08-13 08:34:05
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小虫虫888

新虫 (小有名气)
是一步计算的，有人说把截止到断电时产生的restrt文件作为命令行中-r文件，命令行其余部分保持不变（或修改in文件的nstlim）重新运行就是了 ，可是这样做之后再看时间的横坐标时又从0开始了，不是接着上面的时间跑的，请问你是怎么分段跑的啊？
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3楼2009-08-13 08:58:09
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