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gxiaoyao

金虫 (小有名气)

[求助] 2000bp的碱基缺失后还能回复突变吗?

最近遇到了一怪事:
敲除了某细菌的一个ORF菌落PCR检测和DNA测序证明是正确的敲除菌株,当将正确的单菌落接至LB中培养后进行菌液PCR检测发现有微弱的条带和阳对(出发菌株)一样。开始怀疑是敲除菌株里混有未敲除菌株,所以对刚检测过的菌液再进行平板划线、挑单。再进行菌落PCR检测,发现了好多单菌落都P出了微弱的条带和阳对一样,挑没有出现和阳对一样DNA条带的单菌落再接至LB中培养,再进行菌液PCR检测,又P出了微弱的DNA条带和阳对一样!
如果说是敲除菌株中混有没敲除的菌株,那在我反复分单的情况下肯定会得到纯的敲除菌株。然而事实是我连续分单了2次后分别进行菌落PCR和菌液PCR检测,菌落PCR检测是正确的敲除菌株,相同的菌落在LB液体里生长后在菌液PCR检测就会发现它不完全是正确的敲除菌株。
你们有碰到相似情况吗?我可以将这种现象归结为敲除菌株的回复突变吗?我知道一两个碱基突变后可以发生回复突变,2000bp的碱基缺失后还能回复突变吗?

之前有看到虫友发了类似的帖子,不知道现在解决了吗,欢迎回帖啊
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gxiaoyao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by slcat at 2021-05-10 20:31:37
有没有可能是非特异性条带?可以重新设计被敲除片段内部的引物进行PCR验证,或者把该条带回收测序验证

收到,谢谢
3楼2021-05-12 15:48:49
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查看全部 5 个回答

slcat

新虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
wolfghost: 金币+2, 积极应助奖励~ 2021-05-12 17:28:27
gxiaoyao(qfw_68代发): 金币+5 2021-05-25 15:42:27
qfw_68: 博学EPI+1, 积极应助奖励! 2021-05-25 15:42:39
有没有可能是非特异性条带?可以重新设计被敲除片段内部的引物进行PCR验证,或者把该条带回收测序验证

发自小木虫Android客户端
2楼2021-05-10 20:31:37
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Tosendanin

金虫 (正式写手)

抗病毒药物筛选、酵母/大肠、分子克隆
5楼2023-05-31 23:13:16
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