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ultro

铁杆木虫 (正式写手)

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虫号: 819868
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专业: 等离子体物理

[交流] 【求助】如何使Gaussian输出文件包含虚原子坐标

------------------------------------------------------------------------
                     Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)
CD Cent Atom  N1    Length/X    N2 Alpha/Y    N3    Beta/Z    J
------------------------------------------------------------------------
  1 1  S    0 0.000000       0.000000       0.000000
  2 2  Bq 0 0.000000       0.000000       2.341000
  3 3  Au 0 1.662768       0.000000       2.341000
  4 4  Au 0  -0.831384       1.439999       2.341000
  5 5  Au 0  -0.831384       -1.439999       2.341000
  6 6  S    0  -0.000339       -0.000588       -6.410362
  7 7  Bq 0  -0.000463       -0.000803       -8.751360
  8 8  Au 0  -0.831847       -1.440802       -8.751184
  9 9  Au 0  -0.831847       1.439197       -8.751448
10  10  Au 0 1.662304       -0.000803       -8.751448
11  11  C    0  -0.000016       0.000661       -1.786819
12  12  C    0 1.207352       0.005655       -2.511065
13  13  C    0  -1.207945       -0.004046       -2.511424
14  14  C    0 1.207328       0.005642       -3.899335
15  15  H    0 2.148732       0.009431       -1.974418
16  16  C    0  -1.207965       -0.004062       -3.898924
17  17  H    0  -2.149614       -0.007846       -1.974985
18  18  C    0  -0.000059       0.000636       -4.623567
19  19  H    0 2.148693       0.009403       -4.436015
20  20  H    0  -2.149651       -0.007869       -4.435338
------------------------------------------------------------------------
使用G03W做优化out文件中没有相关虚原子的坐标信息，这样对中间过程检查起来很不方便

。而从其他地方找到的有输出文件包含虚原子，如下表。请各位高手指点一下，该如何做才能达到下面的效果呢？
------------------------------------------------------------------------
                     Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES)
CD Cent Atom  N1    Length/X    N2 Alpha/Y    N3    Beta/Z    J
------------------------------------------------------------------------
  1 1  C
  2 2  C    1 1.407940(  1)
  3 3  C    1 1.408605(  2) 2  118.084( 24)
  4 4  C    2 1.388270(  3) 1  120.956( 25) 3 -0.014( 46) 0
  5 5  H    2 1.083606(  4) 1  119.357( 26) 3  179.994( 47) 0
  6 6  C    3 1.387500(  5) 1  120.959( 27) 2 0.014( 48) 0
  7 7  H    3 1.083754(  6) 1  119.373( 28) 2 -179.995( 49) 0
  8 8  C    4 1.407949(  7) 2  120.958( 29) 1 0.000( 50) 0
  9 9  H    4 1.083608(  8) 2  119.687( 30) 1 -179.992( 51) 0
10  10  H    6 1.083755(  9) 3  119.668( 31) 1  179.992( 52) 0
11  11  S    1 1.786819( 10) 2  120.957( 32) 4  179.975( 53) 0
12    X 11 2.341000( 11) 1  179.979( 33) 2 91.155( 54) 0
13    X 11 2.000000( 12) 1 90.000( 34) 3  -96.450( 55) 0
14    X 11 2.000000( 13) 1 90.000( 35) 2 22.952( 56) 0
15  12  Au 12 1.662768( 14)  11 90.000( 36) 1  -91.379( 57) 0

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1楼2009-08-09 08:44:45

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