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【求助】如何使Gaussian输出文件包含虚原子坐标
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------------------------------------------------------------------------ Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES) CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J ------------------------------------------------------------------------ 1 1 S 0 0.000000 0.000000 0.000000 2 2 Bq 0 0.000000 0.000000 2.341000 3 3 Au 0 1.662768 0.000000 2.341000 4 4 Au 0 -0.831384 1.439999 2.341000 5 5 Au 0 -0.831384 -1.439999 2.341000 6 6 S 0 -0.000339 -0.000588 -6.410362 7 7 Bq 0 -0.000463 -0.000803 -8.751360 8 8 Au 0 -0.831847 -1.440802 -8.751184 9 9 Au 0 -0.831847 1.439197 -8.751448 10 10 Au 0 1.662304 -0.000803 -8.751448 11 11 C 0 -0.000016 0.000661 -1.786819 12 12 C 0 1.207352 0.005655 -2.511065 13 13 C 0 -1.207945 -0.004046 -2.511424 14 14 C 0 1.207328 0.005642 -3.899335 15 15 H 0 2.148732 0.009431 -1.974418 16 16 C 0 -1.207965 -0.004062 -3.898924 17 17 H 0 -2.149614 -0.007846 -1.974985 18 18 C 0 -0.000059 0.000636 -4.623567 19 19 H 0 2.148693 0.009403 -4.436015 20 20 H 0 -2.149651 -0.007869 -4.435338 ------------------------------------------------------------------------ 使用G03W做优化out文件中没有相关虚原子的坐标信息，这样对中间过程检查起来很不方便  。而从其他地方找到的有输出文件包含虚原子，如下表。请各位高手指点一下，该如何做才能达到下面的效果呢？------------------------------------------------------------------------ Z-MATRIX (ANGSTROMS AND DEGREES) CD Cent Atom N1 Length/X N2 Alpha/Y N3 Beta/Z J ------------------------------------------------------------------------ 1 1 C 2 2 C 1 1.407940( 1) 3 3 C 1 1.408605( 2) 2 118.084( 24) 4 4 C 2 1.388270( 3) 1 120.956( 25) 3 -0.014( 46) 0 5 5 H 2 1.083606( 4) 1 119.357( 26) 3 179.994( 47) 0 6 6 C 3 1.387500( 5) 1 120.959( 27) 2 0.014( 48) 0 7 7 H 3 1.083754( 6) 1 119.373( 28) 2 -179.995( 49) 0 8 8 C 4 1.407949( 7) 2 120.958( 29) 1 0.000( 50) 0 9 9 H 4 1.083608( 8) 2 119.687( 30) 1 -179.992( 51) 0 10 10 H 6 1.083755( 9) 3 119.668( 31) 1 179.992( 52) 0 11 11 S 1 1.786819( 10) 2 120.957( 32) 4 179.975( 53) 0 12 X 11 2.341000( 11) 1 179.979( 33) 2 91.155( 54) 0 13 X 11 2.000000( 12) 1 90.000( 34) 3 -96.450( 55) 0 14 X 11 2.000000( 13) 1 90.000( 35) 2 22.952( 56) 0 15 12 Au 12 1.662768( 14) 11 90.000( 36) 1 -91.379( 57) 0 |
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