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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 【求助】Npl3究竟代表哪种N原子
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ourbbc2006

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 【求助】Npl3究竟代表哪种N原子

画分子发现，Npl3 和N2、Nar及Nam均不相同，后面三个我知道，还请高手指点Npl3具体指什么样的N原子？非常感谢！

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-24 at 21:04 ]
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1楼 2009-08-08 12:23:17
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qinqin837

铜虫 (小有名气)
★
yjcmwgk(金币+1):欢迎参加交流
-NH2
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我的ID叫qinqin837，但我不是83年7月生的哦，我没那么大……
2楼2009-08-11 17:49:56
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ourbbc2006

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by qinqin837 at 2009-8-11 17:49:
-NH2

谢谢回复，但我画的分子是嘧啶酮，其中一个N为Nam，另一个是Npl3，都不是-NH2。
继续求解.........
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3楼2009-08-11 18:17:42
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ferlich

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
yjcmwgk(金币+3):欢迎参加交流
yjcmwgk(金币+5,VIP+0):ourbbc2006转给ferlich的5金币 9-1 09:16
本帖内容被屏蔽
4楼2009-08-11 19:17:48
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ourbbc2006

至尊木虫 (著名写手)
yjcmwgk(金币+0,VIP+0):不知道你是啥意思，你是不是说“你不给钱了，让斑竹给”？ 9-1 09:14
yjcmwgk(金币+0,VIP+0):呵呵，明白了，给你扣了5金币，给ferlich加了5金币。呵呵不好意思 9-1 09:17
引用回帖:
Originally posted by ferlich at 2009-8-11 19:17:

平面sp3杂化的N
看这个
http://tripos.com/mol2/atom_types.html
http://snowyowls.blogbus.com/logs/19670607.html

谢谢ferlich指点，请版主转5个金币以表谢意！
还有些不明白的地方：Npl3（即feilich所说的平面sp3杂化的N）有什么特点？与Nam有何区别？为何要单独列为一类？
赞一下(12人) 回复此楼
5楼2009-08-31 23:54:47
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ferlich

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
6楼2009-09-01 19:01:45
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ourbbc2006

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
Originally posted by ferlich at 2009-9-1 19:01:

Nam特指是酰胺的，N原子必需与羰基相连，Npl3类型的是处于平面中（如某些杂环）中的N，这两类N原子的化学性质差异应该比较大。。

谢谢指点！
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7楼2009-09-13 00:22:17
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