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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 公司给的测序结果和参考序列对不上请问是什么原因？
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冰糖胡鲁

新虫 (初入文坛)

[交流] 公司给的测序结果和参考序列对不上请问是什么原因？

请问公司给的测序结果和参考序列对不上是什么原因？可能是样品问题吗？克隆的是DNA，是用NCBI已知序列设计的引物，pcr出来跑胶大小也对的上，没连接载体的情况下可能测出序列吗？
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1楼 2021-04-02 12:43:29
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abcjlm

铜虫 (小有名气)
★
冰糖胡鲁(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
1楼: Originally posted by 冰糖胡鲁 at 2021-04-02 12:43:29
请问公司给的测序结果和参考序列对不上是什么原因？可能是样品问题吗？克隆的是DNA，是用NCBI已知序列设计的引物，pcr出来跑胶大小也对的上，没连接载体的情况下可能测出序列吗？

首先测序出来的结果在ncbi 对比一下，主要是你准备拿这段序列做什么，一般PCR突变概率是比较低的，如果出现很多差异，就考虑一下样品，如果做克隆表达，你看一下翻译后氨基酸的差异

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6楼2021-04-07 20:39:42
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grm枫

铁虫 (初入文坛)
★
冰糖胡鲁(金币+1): 谢谢参与
pcr产物可以直接送测序公司测序，如果测序结果与参考序列不符，可能非特异扩增了（可能存在同源性较高的基因序列）
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4楼2021-04-07 11:09:44
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abcjlm

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by 冰糖胡鲁 at 2021-04-02 12:43:29
请问公司给的测序结果和参考序列对不上是什么原因？可能是样品问题吗？克隆的是DNA，是用NCBI已知序列设计的引物，pcr出来跑胶大小也对的上，没连接载体的情况下可能测出序列吗？

看你之前的帖子，你的基因是逆转录来的吗

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7楼2021-04-07 20:50:44
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tzynew2楼
2021-04-02 12:46   回复  
冰糖胡鲁(金币+1): 谢谢参与
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bjdxyxy5楼
2021-04-07 15:49   回复  
冰糖胡鲁(金币+1): 谢谢参与
。 发自小木虫Android客户端
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