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孤狼1

木虫 (正式写手)

[求助] Autodock求助已有1人参与

我的ligand是一个配合物,里面有金属铜,通过高斯对其结构进行了优化,我在利用autodock做分子对接,做autogrid时出现了这个,请问各位大佬怎么解决?

Autodock求助


Autodock求助-1


Autodock求助-2


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超算试用

禁虫 (初入文坛)

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nono2009: 金币-100, 屏蔽内容, 违规存档, 违规广告 2023-05-23 10:12:17
本帖内容被屏蔽

2楼2021-06-17 16:10:02
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一代米哟

新虫 (小有名气)

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沙漠猎人: 金币-50, 屏蔽内容, 违规存档 2021-12-29 22:40:38
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» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2021-12-29 11:17:05
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孤狼1

木虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 一代米哟 at 2021-12-29 11:17:05
AutoDock本身不支持Cu元素,没有它的参数,需要自己补充,比较麻烦。建议使用DOCK 6,可以在百度搜一下【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(DOCK6)】计算教程。

我找了相关的参数文件AD4_parameters,把这个放进去了,但还是不行

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4楼2021-12-29 11:22:18
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