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孤狼1

木虫 (正式写手)

[求助] Autodock求助 已有1人参与

我的ligand是一个配合物，里面有金属铜，通过高斯对其结构进行了优化，我在利用autodock做分子对接，做autogrid时出现了这个，请问各位大佬怎么解决？

Autodock求助


Autodock求助-1


Autodock求助-2


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1楼 2021-04-02 09:05:37
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超算试用

禁虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
nono2009: 金币-100, 屏蔽内容, 违规存档, 违规广告 2023-05-23 10:12:17
本帖内容被屏蔽
2楼2021-06-17 16:10:02
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一代米哟

新虫 (小有名气)
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沙漠猎人: 金币-50, 屏蔽内容, 违规存档 2021-12-29 22:40:38
本帖内容被屏蔽

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

孤狼1
3楼2021-12-29 11:17:05
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孤狼1

木虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 一代米哟 at 2021-12-29 11:17:05
AutoDock本身不支持Cu元素，没有它的参数，需要自己补充，比较麻烦。建议使用DOCK 6，可以在百度搜一下【蛋白/核酸/多肽-小分子对接(DOCK6)】计算教程。

我找了相关的参数文件AD4_parameters，把这个放进去了，但还是不行

发自小木虫Android客户端
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4楼2021-12-29 11:22:18
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