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yy0520yy

金虫 (职业作家)

[交流] 关于加氢!!!!

大家讨论一下加氢的经验,我是新手,在家请的问题上不甚了解,不管三七二十一,就用命令HADD加氢,然后改一下INS中加氢的type,看来这样是不够的,经常出现后续问题。大家多多指教!
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yy0520yy

金虫 (职业作家)

是不是键长键角不合理的check的时候就出现警告啊,dfix的命令我还没用过,经常见到警告说键长不合适,不止是碳氢键长还有碳碳键长或是碳氮键长。
3楼2009-08-07 10:52:01
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xiaoyang09

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 8-26 08:41
一般是这样:在骨架确定无误之后再加氢,如果是C上的氢,大多用hadd$c命令,如果是游离水溶剂上的氢,一般是用合适的q峰投出来,有时为了键长键角更合理还在ins文件中用dfix加以固定
定云止水,鸢飞鱼跃
2楼2009-08-07 10:48:22
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xiaoyang09

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
paopaomeng(金币+1,VIP+0):谢谢交流 8-26 08:42
一般碳环加氢都用hadd,只要骨架没问题,一般都不会有什么警告啊?不知道你说的在ins里面改加氢type怎么改的?具体用什么命令啊?
定云止水,鸢飞鱼跃
4楼2009-08-07 12:18:07
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