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yitahutu

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于BSSE校正问题已有2人参与

根据以前论坛里的方法,用笛卡尔坐标分成了两个部分,给大家看看输入文件

0,1
O,-3.3139046751,3.274642247,6.6961469946,1
Cl,-1.9921210153,2.8284254822,6.2108903119,1
N,-2.0560431796,1.8169501812,3.1196713198,1
O,-0.9469754243,2.9246414934,7.243712536,1
O,-2.0968552773,1.3742998002,5.7368930013,1
O,-1.5889649023,3.6643874296,4.9988283616,1
H,-2.9276057887,1.8117616447,2.5893536071,1
H,-2.1621562143,1.3158494939,4.0472681451,1
H,-1.2973775872,1.4226590574,2.5460911575,1
H,-1.8309890433,2.7726167925,3.4901079337,1
C,0.1791707932,-1.5342724205,-3.789827674,2
N,1.5954603038,-1.3089088062,-3.9970643158,2
N,-0.1569909123,-2.0755839399,-2.4724737832,2
H,-0.364806944,-0.5905686841,-3.8712871814,2
H,-0.1419847962,-2.2058946396,-4.5855031932,2
C,2.4856006783,-0.7290727289,-2.9709574988,2
N,2.2523893761,-2.094542983,-4.9475905792,2
N,0.1623602984,-3.4152510878,-2.2078664299,2
C,-0.9221957836,-1.3619080904,-1.4898910626,2
O,1.5728782221,-2.6589789345,-5.7922516241,2
O,3.4780468363,-2.0973823387,-4.8608512932,2
O,-0.1199242469,-3.8343142737,-1.0918382862,2
O,0.7206030991,-4.018004671,-3.113832146,2
N,1.7326019313,-0.0050998003,-1.974846693,2
N,-0.0385486629,-0.7335952371,-0.4750940218,2
H,3.1895025574,-0.0572073498,-3.4587005746,2
H,3.0483188023,-1.5197806496,-2.4671457528,2
H,-1.6013802153,-2.04093408,-0.9770263095,2
H,-1.5056755919,-0.5872981496,-1.9936729838,2

命令用的,# MP2/6-31G Counterpoise=2 Opt

但是不能进行计算
不知道是不是哪里有问题,请教高手帮忙看看。第一次做BSSE校正,很多不明白。

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-12-14 at 10:11 ]
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iacwj03

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by hzfish at 2009-12-13 10:18:37:
用counterpoise=2计算
分子结构说明部分需要指定总的charge,spin和各分子版的charge,spin。

能不能详细说明下怎么分别指定总的charge,spin和各分子的charge,视频?举个例子吧
7楼2010-04-21 20:52:22
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yongleli

木虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
mingdong(金币+5,VIP+0):感谢交流! 9-1 22:28
yitahutu(金币+1,VIP+0):谢谢 9-2 09:24
转述别人的观点:

用counterpoise关键词(默认取counterpoise=2)自动计算的好处在于方便,不用自己写虚原子,而且还能比手动计算节约磁盘空间。但不利之处在于它对复合体系的能量又重新进行了单点计算(一般我们在优化构型时已经得到了此能量),耽误时间。所以,如果你很在意计算时间,手动计算BSSE倒是不错的选择。在手动计算counterpoise的BSSE时,最好用“元素符号-Bq”的方式(如C-Bq, H-Bq, ...)来定义虚原子,这样做的好处是程序能自动指派基组,而不必费力去使用Gen关键词。

        在使用G03计算counterpoise的BSSE时,最常见的程序出错是“Inaccurate quadrature in CalDSu”。其原因往往是在link401中无法确定猜测波函数。在G03中默认的猜测波函数是Harris范函,与G98中的不一样。

        另外,如果使用Bq虚原子或Gen基组手动计算BSSE时,也可能出现上述出错。其原因是因为程序的积分格点没有落在虚原子上,因此虚原子上的基函数无法正确进行积分。

      其解决办法是:

      1.  添加Guess=Indo选项。

   2. 去掉对称性限制。如果你的复合体系有对称性或者近似对称且你使用了SYMM=loose选项,那么,有时也会导致上述出错。此时,如果去掉对称性(使用NOSYMM关键词),往往能解决问题。
3楼2009-09-01 18:03:58
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yongleli

木虫 (正式写手)

★ ★
fegg7502(金币+1,VIP+0):thank you very much! 9-1 23:51
yitahutu(金币+1,VIP+0):嗯,谢谢 9-2 09:25
还有,你的逗号是怎么回事?
好像不应该有这些。。。
4楼2009-09-01 19:03:16
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hzfish

金虫 (正式写手)


fegg7502(金币+1,VIP+0):thank you very much! 12-13 17:05
用counterpoise=2计算
分子结构说明部分需要指定总的charge,spin和各分子版的charge,spin。
5楼2009-12-13 10:18:37
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