应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 综合其他 » 生物学分析网站[重复了，不好意思]
31/1返回列表
查看: 341  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前主题已经存档。

acq613

银虫 (正式写手)

[交流] 生物学分析网站[重复了，不好意思]

综合工具
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool)

http://www.bionavigator.com , 功能最为完整的网上服务器。包括核酸的酶切位点、motif、开读框等搜索，PCR引物设计，二级结构预测，多序列比较及分子进化树构建，等等；蛋白分析则包括酶切图谱，功能区搜索，分子进化分析，蛋白二级结构预测，等等；此外还提供序列管理等功能。收费站点，但提供两周的全功能免费试用期

http://bioinformatics.weizamann.ac.il/gdp/gdp.html ， 另一个综合性的提供序列分析功能的网站

http://www.hgsc.bcm.tmc.edu ,内容丰富的站点，有数据库及教程、在线分析工具等，常用其预测编码区、搜索启动子和结合位点等功能

编码区统计特性分析

http://cbrg.inf.ethz.ch ,常用其基因预测及验证功能，预测DNA序列的外显子。 还有其它一些在线服务

启动子及调控元件分析

BDGP-promoter

Tfsitescan

内含子/外显子剪接位点

NetGene服务的Email地址是： netgene@cbs.dtu.dk

重复序列分析

CENSOR的Email服务地址是： censor@sharon.lpi.org

XBLAST： ftp://ncbi.nlm.nih.gov/pub/jmc

Repbase： ftp://ncbi/nlm.nih.gov/repository/repbase/REF

从氨基酸组成辨识蛋白质

ExPASy： http://www.expasy.ch/tools/

PROSEARCH： http://www.embl-heidelberg.de/prs.html

预测蛋白质的物理性质： 等电点、分子量、酶切特性、疏水性、电荷分布等

ExPASy： http://www.expasy.ch/tools/ ，有较多的蛋白分析工具，包括分子量、亲疏水性、表面积、二级结构、与SWISS-PROT数据库收录分子同源性比较、极性、折射率等分析

FASTA： ftp://ftp.virginia.edu/pub/fasta/

SAPS： http://www.isrec.isb-sib.ch/software/SAPS_form.html

跨膜区预测： http://www.isrec.isb-sib.ch/software/tmpred_from.html

蛋白质二级结构预测

nnPredict： http://www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict.html

PredictProtein： http://cubic.bioc.columbia.edu/predictprotein/

PredictProtein的国内镜像： http://www.cbi.pku.edu.cn/predictprotein/

SOPMA： http://pbil.ibcp.fr/

二级结构预测： www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict-instrucs.html

卷曲螺旋预测

COILS： http://www.ch.embnet.org/software/COILS_form.html

跨膜区段和在膜上的取向预测

TMpred： http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html

信号肽的剪切位点

SignalP： http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/

蛋白质的三维结构

SWISS-MODEL： http://www.expasy.ch/swissmod/SWISS-MODEL.html

CPHmodels： http://www.cbs.dtu.dk/services/CPHmodels/

启动子分析网站：

http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/
http://www.dna.affrc.go.jp/PLACE/signalscan.html
http://www.fruitfly.org/seq_tools/promoter.html

[ Last edited by acq613 on 2009-8-5 at 23:30 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

生物信息相关

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2009-08-05 23:28:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小太阳3369

木虫 (著名写手)

悠悠我心
不错，收藏了
楼主辛苦了
赞一下 回复此楼
(*^__^*)嘻嘻……
2楼2009-08-05 23:30:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wxy6576338
3楼2009-08-06 00:07:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 acq613 的主题更新
31/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 师弟论文见刊大半年才想起来申请专利，还能抢救一下吗？ +5 13108017953 2026-09-21 5/250 2026-09-27 16:46 by Leogzhya
[教师之家] 某top大学教授说“能够在市场中兑现的能力才是真能力”无比同意！ +3 zju2000 2026-09-26 3/150 2026-09-27 16:26 by lala1008
[博后之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:42 by 4IW0sJvtEqX8
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:26 by 4IW0sJvtEqX8
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:21 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:03 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 oeyPlfmMUpOC 2026-09-26 3/150 2026-09-27 09:13 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:42 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:39 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:32 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:08 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:05 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:53 by XgCC8uTcwILl
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:50 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 6/300 2026-09-27 05:42 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 7/350 2026-09-25 11:18 by yhq9807
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭