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2008116068木虫 (著名写手)
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[交流]
细菌 16S
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各位大虾好，我将要做“ 转基因植物对土壤微生物的影响” 这方面的实验，主要是DGGE。 现在正在找合适的引物来做PCR，请给点建议和意见？谢谢！ 另外，16S分区是怎么回事啊？比如V3,V4-V6,V6-V9之类。 非常感谢各位大虾回帖！！！ [ Last edited by 2008116068 on 2009-7-31 at 13:07 ] |
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2楼2009-07-31 15:13:43
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amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流！ 8-1 09:26
2008116068(金币+1,VIP+0):谢谢回复区，比较详细。不过那几个有什么不同啊？ 8-2 17:52
2008116068(金币+1,VIP+0):追送一个啦 8-3 09:39
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2008116068(金币+1,VIP+0):追送一个啦 8-3 09:39
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ssu基因作物分子标记物 本身具有三个特征 1 广泛分布（原核生物100%） 2 相对稳定（16S 小亚基基本不变） 3 物种间有差异 V=variety 变化 通过序列比较可以发现ssu基因有一些区域不宜变化，而变化区域就被命名为V1、V2、V3……V9 关于用哪个区来做DGGE有不少文章 Sanchez, O., J. M. Gasol, et al. (2007). "Comparison of Different Denaturing Gradient Gel Electrophoresis Primer Sets for the Study of Marine Bacterioplankton Communities." Appl. Environ. Microbiol. 73(18): 5962-5967 Lopez, I., F. Ruiz-Larrea, et al. (2003). "Design and Evaluation of PCR Primers for Analysis of Bacterial Populations in Wine by Denaturing Gradient Gel Electrophoresis." Appl. Environ. Microbiol. 69(11): 6801-6807 不好说哪个引物最好，不过可以参考文献进行。 |
5楼2009-08-01 09:13:56
6楼2009-08-06 09:08:37
