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chuan2388

金虫 (小有名气)

[交流] NCBI中一菌株有多个基因组,怎么选择?

各位虫友,我在NCBI中查找一个菌株的基因组,结果给出多个不同的结果,我该怎么选择呢?我是过用Clastw进行了比对,但因序列太长,比对的结果不能直观的看出各个基因组到底有哪些不同。请问有没有更简单直观的方法找出个基因组的不同?谢谢!
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把时间都浪费在自己身上吧!
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catty829

银虫 (小有名气)

你是做鉴定吧?


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
做系统发育树的话,应该选取几个序列来比对。但是这些序列最好不要相似度太高,否则作出的发育树不好看
8楼2009-07-31 12:45:49
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hyde0706

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
好像只有通过比对了吧?NCBI会有一个参考序列吧?拿其他序列和这个序列进行比对,比较保守度最高的序列。
4楼2009-07-31 09:46:43
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zfszheng

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
应该不同基因组是这种菌株的不同亚种,我是自己这样认为的。请各位大侠指教!!!!
5楼2009-07-31 09:59:58
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350784478

木虫 (正式写手)

我也想知道
朝为田舍郎,暮登天子堂。将相本无种,男儿当自强。
6楼2009-07-31 10:24:58
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