24小时热门版块排行榜    

查看: 787  |  回复: 8
当前主题已经存档。

chuan2388

金虫 (小有名气)

[交流] NCBI中一菌株有多个基因组,怎么选择?

各位虫友,我在NCBI中查找一个菌株的基因组,结果给出多个不同的结果,我该怎么选择呢?我是过用Clastw进行了比对,但因序列太长,比对的结果不能直观的看出各个基因组到底有哪些不同。请问有没有更简单直观的方法找出个基因组的不同?谢谢!
回复此楼
把时间都浪费在自己身上吧!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fz-xyz

银虫 (小有名气)

我也想知道~
追求科学
2楼2009-07-31 09:41:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuangqli

金虫 (小有名气)

长度大小
3楼2009-07-31 09:45:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hyde0706

木虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
好像只有通过比对了吧?NCBI会有一个参考序列吧?拿其他序列和这个序列进行比对,比较保守度最高的序列。
4楼2009-07-31 09:46:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zfszheng

新虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
应该不同基因组是这种菌株的不同亚种,我是自己这样认为的。请各位大侠指教!!!!
5楼2009-07-31 09:59:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

350784478

木虫 (正式写手)

我也想知道
朝为田舍郎,暮登天子堂。将相本无种,男儿当自强。
6楼2009-07-31 10:24:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

brightfuture01

木虫之王 (文坛精英)

我爱打老虎

文献杰出贡献


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
即便是一个种,也有不同的株系啊.呵呵,不同株系的基因组也是有些许差异的.
The world is a fine place and worth fighting for. I agree with the second part.
7楼2009-07-31 10:59:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

catty829

银虫 (小有名气)

你是做鉴定吧?


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
做系统发育树的话,应该选取几个序列来比对。但是这些序列最好不要相似度太高,否则作出的发育树不好看
8楼2009-07-31 12:45:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

a09050074

铜虫 (小有名气)

我也想知道该怎么办。。。
9楼2009-07-31 16:08:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 chuan2388 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +28 医学老男孩 2026-08-13 59/2950 2026-08-15 19:38 by pztchina
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +12 archvillain 2026-08-15 21/1050 2026-08-15 19:30 by pztchina
[基金申请] 有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验) +8 majunge000 2026-08-11 10/500 2026-08-15 18:55 by Equinoxhua
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +7 Ldrop2023 2026-08-13 7/350 2026-08-15 15:57 by mzhh2000
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[基金申请] filecode +15 documentary 2026-08-10 17/850 2026-08-14 10:08 by kissu88
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +10 家与远方 2026-08-10 15/750 2026-08-14 02:08 by 绵羊哥哥
[文学芳草园] 阿姨 +4 汪汪锅 2026-08-09 4/200 2026-08-13 19:43 by arzu_hma
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
[基金申请] 面上项目filecode邪修 +5 西山十月 2026-08-09 7/350 2026-08-10 07:32 by 仁砚薪传
信息提示
请填处理意见