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zjwang

木虫 (正式写手)

[交流] mapping定位不到染色体上怎么回事?

大家好!做实验遇到了难题,不知道怎么解决。我们筛选到一个短根,不育的突变体,杂交后代中表型分离比是4.5:1,不是典型的3:1分离。做mapping中,用粗定位的marker筛选,没有明显的连锁。大侠们说说可能是什么原因?如果表型是母性遗传,会影响粗定位吗?因为群体是用突变体做母体做的杂交。还有表型分离比是4.5:1可能是什么原因呢?

[ Last edited by 350784478 on 2009-7-30 at 12:05 ]
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350784478

木虫 (正式写手)

帮你顶起,友情顶贴。
朝为田舍郎,暮登天子堂。将相本无种,男儿当自强。
2楼2009-07-30 12:06:19
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蓝皮鼠7983

至尊木虫 (文坛精英)

飞过蓝天

★ ★
司马诸葛(金币+1,VIP+0):谢谢交流 7-30 17:49
zjwang(金币+1,VIP+0): 7-30 18:35
杂交后代中表型分离比是4.5:1
群体足够大吗?
海到尽头天做岸,山登绝顶我为峰。
3楼2009-07-30 12:23:13
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zjwang

木虫 (正式写手)

★
amisking(金币+1,VIP+0):欢迎发帖交流! 7-30 20:03
群体足够大,300左右吧。我觉得可能是影响育性,基因传递效率有问题,所以想分别以突变体为母本和父本进行杂交,然后看后代的分离比。
4楼2009-07-30 18:35:00
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wdgsmv58

铁杆木虫 (正式写手)

★ ★
amisking(金币+1,VIP+0):欢迎发帖交流! 7-30 20:03
zjwang(金币+1,VIP+0): 7-31 08:28
你用的marker在突变体和野生型之间的多态性很明显吗?
你的群体如果存在母性效应,及细胞质遗传,则肯定会影响表型的分离比例的,不知道你做了反交没?3:1的卡平方适合性测验做了没?
海纳百川,有容乃大!壁立千仞,无欲则刚!
5楼2009-07-30 19:43:55
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amisking

荣誉版主 (文坛精英)

优秀区长优秀版主

顶下!
如果没有人帮助你,那么你就去帮助别人。
6楼2009-07-30 20:03:18
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zjwang

木虫 (正式写手)

★ ★
amisking(金币+2,VIP+0):欢迎发帖交流! 7-31 12:36
"你用的marker在突变体和野生型之间的多态性很明显吗?
你的群体如果存在母性效应,及细胞质遗传,则肯定会影响表型的分离比例的,不知道你做了反交没?3:1的卡平方适合性测验做了没?"

谢谢wdgsmv58 ,marker的多态性还是很明显的,用的是sslp marker,就是感觉杂合都挺多的。卡方测验做过了,不适合3:1,下步打算做反交。
7楼2009-07-31 08:41:15
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zjwang

木虫 (正式写手)

我现在觉得可能是基因在父本或者母本的传递效率有问题,如果在母本中能正常传递,但是父本中只有部分传递(如占总数的2/5),那么表型分离就是1/2x2/5=1/5,现在打算通过正反交验证这种假设。
8楼2009-07-31 08:44:55
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wdgsmv58

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zjwang at 2009-7-31 08:44:
我现在觉得可能是基因在父本或者母本的传递效率有问题,如果在母本中能正常传递,但是父本中只有部分传递(如占总数的2/5),那么表型分离就是1/2x2/5=1/5,现在打算通过正反交验证这种假设。

可以试试
祝你成功!
海纳百川,有容乃大!壁立千仞,无欲则刚!
9楼2009-07-31 12:32:34
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