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381466632

木虫 (正式写手)

[交流] pfu 的pcr问题

每次都p出来两条带,但是我的目的条带很弱,回收不出来。请教一下怎样可以增强我的目的,减少非特异性条带?谢谢。我用的是65 退火1分钟,延伸1分30秒。28循环。
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fz-xyz

银虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by 381466632 at 2009-7-28 14:51:


首先谢谢你,可不可以把oligo看错配说得详细点,学习一下。还有我的扩增条带1900左右。退火时间需要延长吗?

oligo进去后输入模版序列,
edit中输入上下引物序列
analyze中的false priming可以查看配对效率。
效率越高,配对越好。

我用的是oligo 6
追求科学
23楼2009-07-31 09:35:15
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witch-dj

木虫 (著名写手)

快乐家族-witchdj

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
381466632(金币+1,VIP+0): 7-28 14:53
延伸时间增长为3min,退火温度在调节一下,根据引物的Tm值,试试看
2楼2009-07-28 08:09:20
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fz-xyz

银虫 (小有名气)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
381466632(金币+1,VIP+0):谢谢, 7-28 14:53
两条带的话可以用oligo看看到底是哪里的错配,之后修改Tm值。
或者直接尝试不同Tm值。
退火时间应该是根据目的条带长短确定的啊~
追求科学
3楼2009-07-28 08:45:20
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hyde0706

木虫 (正式写手)


381466632(金币+1,VIP+0): 7-28 14:53
首先考虑降低退火温度,可以提高扩增效率。适当增加延伸时间,不过这个效果不是很明显。可以增加一些PCR增强剂,甘油可以抑制非特异扩增,BSA可以提高扩增效率。
4楼2009-07-28 10:51:52
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