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fit<-lmFit(eset,design)
contrast.matrix<-makeContrasts(EPvsCO = EP-CO,levels = design)
fit2<-contrasts.fit(fit,contrast.matrix)
fit2e<-eBayes(fit2)

tested2<-topTable(fit2e,adjust="fdr",number = Inf,sort.by = "B",coef = 1)

3楼: Originally posted by bcsnow at 2021-01-07 09:25:27
没有数据，没有包，没有函数，假设前面三个都没问题的话，代码没有问题。没有图，看不到问题，我猜是数据的具体特点造成的。