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VASP计算时进程老是被kill
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我计算光学性质时,进程在运行1分钟左右就被kill: BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES RANK 0 PID 10718 RUNNING AT localhost.localdomain KILLED BY SIGNAL: 9 (killed) (或者是KILL BY SIGNAL: 11 (Segmentation fault)) 一开始以为是内存不足,用top命令查看内存,发现占用始终没超过60%。我把oom killer关闭了,还是如此。我以为是虚拟内存的问题,把虚拟内存 swappiness调到0,并且用free查看内存使用,没发现虚拟内存被使用,结果还是这样。我实在想不出来为什么,快要被这个东西折磨疯了,求各位大佬救助。 我计算的体系是β-Ga2O3的原胞(4个Ga,6个O),已经进行SCF,在使用LOPTICS=.T.时出现这个问题。 INCAR: Optical properties ALGO = Exact NBANDS = 156 (SCF的NBANDS是52,后来计算时调小过,还是gg) LOPTICS = .TRUE. CSHIFT = 0.100 NEDOS = 2000 ISMEAR = 0 SIGMA = 0.01 EDIFF = 1E-8 LREAL=Auto NCORE=8 KPAR=1 KPOINTS: KPT-Resolved Value to Generate K-Mesh: 0.040 0 Monkhorst-Pack 8 8 4 0.0 0.0 0.0 POSCAR: Primitive Cell 1.000000 6.11499977110000 -1.51999998095000 0.00000000000000 6.11499977110000 1.51999998095000 0.00000000000000 -1.37366099220000 0.00000000000000 5.63498515450000 Ga O 4 6 DIRECT 0.0903999935816327 0.0903999935816326 0.7947999834876939 Ga1 0.9096000064183674 0.9096000064183674 0.2052000165123061 Ga2 0.3414000142227951 0.3414000142227950 0.6856999993450472 Ga3 0.6585999857772049 0.6585999857772049 0.3143000006549528 Ga4 0.1674000043244401 0.1674000043244400 0.1010999976273319 O1 0.8325999956755600 0.8325999956755599 0.8989000023726681 O2 0.4957000035898141 0.4957000035898140 0.2552999854136528 O3 0.5042999964101860 0.5042999964101860 0.7447000145863472 O4 0.8278999943101788 0.8278999943101788 0.4365000127437337 O5 0.1721000056898213 0.1721000056898211 0.5634999872562663 O6 OUTCAR (最后几行) Maximum index for non-local projection operator 410 Maximum index for augmentation-charges 1255 (set IRDMAX) -------------------------------------------------------------------------------------------------------- initial charge from wavefunction First call to EWALD: gamma= 0.376 Maximum number of real-space cells 4x 4x 2 Maximum number of reciprocal cells 4x 4x 3 FEWALD: cpu time 0.0029: real time 0.0030 --------------------------------------- Iteration 1( 1) --------------------------------------- POTLOK: cpu time 0.0299: real time 0.0309 SETDIJ: cpu time 0.0051: real time 0.0052 total amount of memory used by VASP MPI-rank0 669253. kBytes ======================================================================= base : 30000. kBytes nonlr-proj: 1015. kBytes fftplans : 1106. kBytes grid : 1792. kBytes one-center: 31. kBytes wavefun : 635309. kBytes 我用的机器是8线程,16g内存。后来换了个机器,16线程48g内存,还是有这个问题,并且内存占用也不高,我寻思不是内存的问题啊,真是百思不得其解。 |
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