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南方科技大学公共卫生及应急管理学院2025级博士研究生招生报考通知
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渌口区街霸

新虫 (初入文坛)

[求助] VASP计算时进程老是被kill

我计算光学性质时,进程在运行1分钟左右就被kill:
BAD TERMINATION OF ONE OF YOUR APPLICATION PROCESSES
RANK 0 PID 10718 RUNNING AT localhost.localdomain
KILLED BY SIGNAL: 9 (killed)
(或者是KILL BY SIGNAL: 11 (Segmentation fault))

一开始以为是内存不足,用top命令查看内存,发现占用始终没超过60%。我把oom killer关闭了,还是如此。我以为是虚拟内存的问题,把虚拟内存 swappiness调到0,并且用free查看内存使用,没发现虚拟内存被使用,结果还是这样。我实在想不出来为什么,快要被这个东西折磨疯了,求各位大佬救助。 我计算的体系是β-Ga2O3的原胞(4个Ga,6个O),已经进行SCF,在使用LOPTICS=.T.时出现这个问题。

INCAR:
Optical properties
ALGO     =  Exact
NBANDS   =  156   (SCF的NBANDS是52,后来计算时调小过,还是gg)        
LOPTICS  = .TRUE.
CSHIFT   =  0.100
NEDOS    =  2000
ISMEAR   =  0
SIGMA    =  0.01
EDIFF    =  1E-8  
LREAL=Auto
NCORE=8
KPAR=1

KPOINTS:
KPT-Resolved Value to Generate K-Mesh: 0.040
0
Monkhorst-Pack
   8   8   4
0.0  0.0  0.0

POSCAR:
Primitive Cell
  1.000000
    6.11499977110000   -1.51999998095000    0.00000000000000
    6.11499977110000    1.51999998095000    0.00000000000000
   -1.37366099220000    0.00000000000000    5.63498515450000
  Ga  O
   4   6
DIRECT
    0.0903999935816327    0.0903999935816326    0.7947999834876939    Ga1
    0.9096000064183674    0.9096000064183674    0.2052000165123061    Ga2
    0.3414000142227951    0.3414000142227950    0.6856999993450472    Ga3
    0.6585999857772049    0.6585999857772049    0.3143000006549528    Ga4
    0.1674000043244401    0.1674000043244400    0.1010999976273319     O1
    0.8325999956755600    0.8325999956755599    0.8989000023726681     O2
    0.4957000035898141    0.4957000035898140    0.2552999854136528     O3
    0.5042999964101860    0.5042999964101860    0.7447000145863472     O4
    0.8278999943101788    0.8278999943101788    0.4365000127437337     O5
    0.1721000056898213    0.1721000056898211    0.5634999872562663     O6

OUTCAR (最后几行)
Maximum index for non-local projection operator          410
Maximum index for augmentation-charges         1255 (set IRDMAX)
--------------------------------------------------------------------------------------------------------
initial charge from wavefunction
First call to EWALD:  gamma=   0.376
Maximum number of real-space cells 4x 4x 2
Maximum number of reciprocal cells 4x 4x 3
    FEWALD:  cpu time    0.0029: real time    0.0030
--------------------------------------- Iteration      1(   1)  ---------------------------------------
    POTLOK:  cpu time    0.0299: real time    0.0309
    SETDIJ:  cpu time    0.0051: real time    0.0052
total amount of memory used by VASP MPI-rank0   669253. kBytes
=======================================================================
   base      :      30000. kBytes
   nonlr-proj:       1015. kBytes
   fftplans  :       1106. kBytes
   grid      :       1792. kBytes
   one-center:         31. kBytes
   wavefun   :     635309. kBytes

我用的机器是8线程,16g内存。后来换了个机器,16线程48g内存,还是有这个问题,并且内存占用也不高,我寻思不是内存的问题啊,真是百思不得其解。
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worldgogo

新虫 (职业作家)

实验与理论去缺一不可。
2楼2020-12-20 10:13:55
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德彪西

新虫 (初入文坛)

请问解决了吗?
怎么解决的?
3楼2022-04-29 19:45:59
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叶石纹

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 德彪西 at 2022-04-29 19:45:59
请问解决了吗?
怎么解决的?

您好,这个问题解决了吗?
4楼2022-07-07 21:16:19
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