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glai8818

木虫 (著名写手)

[交流] 【讨论】并行计算与体系的大小

大家好,我在用gromacs做并行计算的时候,5000(大约)个原子以下的体系并行效率很高,四个核都100%运行,而对更大的体系,则效率很差,四个核都只占用70%,最后总的效率还不如单核计算的,而通常到中途计算就中断了。很奇怪啊,既然cpu没有完全占用,那么说明不是cpu的问题,是内存的原因吗?我的内存很大的啊,4G,困惑中......
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glai8818

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by tjpm at 2009-7-25 21:53:
intel的最新的E5500系列之前的CPU或者是 桌面I7之前的intel全系CPU都很可能出现这样的问题。
受前端总线的限制。
AMD的CPU基本上会好很多的。不过最新的intel的U加了内存控制器后比AMD的还强了。
不过照理说你 ...

我的cpu是Q8200
.....
5楼2009-07-25 22:06:22
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tjpm

金虫 (正式写手)

★ ★
glai8818(金币+2,VIP+0):谢谢第一个回帖 7-25 21:43
4GB内存也算大啊....

I/O方面也有问题吧,而且通信开销也大
2楼2009-07-25 21:36:47
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glai8818

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by tjpm at 2009-7-25 21:36:
4GB内存也算大啊....

I/O方面也有问题吧,而且通信开销也大

但是我查看实际上只用了1/6内存啊,能否说的详细点,加入时I/O问题,如何查证或试着解决呢? 我单核计算不管多大的体系,总是能正常运行的啊

[ Last edited by glai8818 on 2009-7-25 at 21:45 ]
.....
3楼2009-07-25 21:43:26
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tjpm

金虫 (正式写手)

★ ★ ★ ★ ★
glai8818(金币+1,VIP+0):ths 7-25 22:06
mingdong(金币+4,VIP+0):谢谢交流! 7-28 11:58
intel的最新的E5500系列之前的CPU或者是 桌面I7之前的intel全系CPU都很可能出现这样的问题。
受前端总线的限制。
AMD的CPU基本上会好很多的。不过最新的intel的U加了内存控制器后比AMD的还强了。
不过照理说你的内存才用这么点应该不会有多大问题的。其他的我也不了解了,没有用过这个东西。
4楼2009-07-25 21:53:50
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