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kitt200902

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 土壤细菌测序扩增不合格

大家好,小弟前段时间让公司帮忙做一下土壤样品16s测序,结果有几个样品给的检测结果一直是“扩增不合格”。公司那边说可能是样本细菌含量较少,有效浓度低。我本人没做过分子方面的实验,这种情况下该怎么办?让公司换方法重新提取可以吗?
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shao_sylvia

银虫 (小有名气)

你好,给的信息有点少,不好判断。我之前有做过16s测序,最初做不出来东西的时候,排除的因素有1.样品纯度不够,受到其他杂质干扰 2. 样品DNA量不够,或者已分解。 一般DNA提取的方法很成熟,你给的样品量够吗?普通土壤0.5克,都能有很多dna,大概在200 ng/ul 以上,如果受污染土壤,可能很少,你需要提供大量样品。如果是样品纯度不够,你可以让他们帮你纯化,去除一些杂质。
2楼2021-01-21 09:50:46
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hopegate

捐助贵宾 (小有名气)

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3楼2021-05-11 17:10:03
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