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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 土壤细菌测序扩增不合格
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kitt200902

至尊木虫 (著名写手)

[求助] 土壤细菌测序扩增不合格

大家好，小弟前段时间让公司帮忙做一下土壤样品16s测序，结果有几个样品给的检测结果一直是“扩增不合格”。公司那边说可能是样本细菌含量较少，有效浓度低。我本人没做过分子方面的实验，这种情况下该怎么办？让公司换方法重新提取可以吗？
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1楼 2020-12-09 19:21:39
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shao_sylvia

银虫 (小有名气)
你好，给的信息有点少，不好判断。我之前有做过16s测序，最初做不出来东西的时候，排除的因素有1.样品纯度不够，受到其他杂质干扰 2. 样品DNA量不够，或者已分解。 一般DNA提取的方法很成熟，你给的样品量够吗？普通土壤0.5克，都能有很多dna,大概在200 ng/ul 以上，如果受污染土壤，可能很少，你需要提供大量样品。如果是样品纯度不够，你可以让他们帮你纯化，去除一些杂质。
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2楼2021-01-21 09:50:46
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hopegate

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3楼2021-05-11 17:10:03
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