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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 晶体数据检查B类错误求大侠指点，谢谢大侠
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cyg801116

银虫 (小有名气)

[求助] 晶体数据检查B类错误求大侠指点，谢谢大侠 已有1人参与

PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O3 ..O7 . 2.69 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O4 ..O5 . 2.69 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O4 ..O8 . 2.70 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O5 ..O8 . 2.61 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O6 ..O7 . 2.62 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F1 ..O4 . 2.56 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F1 ..O5 . 2.58 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F1 ..O8 . 2.61 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F2 ..O7 . 2.55 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F2 ..O3 . 2.59 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F2 ..O6 . 2.59 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
晶体检查出现这些B类错误，利用DFix命令无效，也没有氢键之类的。无机物晶体结构。求助大侠帮忙，谢谢大侠！
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1楼 2020-12-07 22:36:03
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grenemal

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O3 ..O7 . 2.69 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O4 ..O5 . 2.69 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O4 ..O8 . 2.70 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O5 ..O8 . 2.61 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O6 ..O7 . 2.62 Ang.
x,y,z = 1_555 Check，
这些是要你检测两个氧之间的距离，通常距离是要小于两个原子范德华半径之和减0.2的

PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F1 ..O4 . 2.56 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F1 ..O5 . 2.58 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F1 ..O8 . 2.61 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F2 ..O7 . 2.55 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F2 ..O3 . 2.59 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F2 ..O6 . 2.59 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
同上，要检测F原子和氧原子之间的距离
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2楼2020-12-08 11:31:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

grenemal

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O3 ..O7 . 2.69 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O4 ..O5 . 2.69 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O4 ..O8 . 2.70 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O5 ..O8 . 2.61 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O6 ..O7 . 2.62 Ang.
x,y,z = 1_555 Check，
这些是要你检测两个氧之间的距离，通常距离是要小于两个原子范德华半径之和减0.2的

PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F1 ..O4 . 2.56 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F1 ..O5 . 2.58 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F1 ..O8 . 2.61 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F2 ..O7 . 2.55 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F2 ..O3 . 2.59 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT431_ALERT_2_B Short Inter HL..A Contact F2 ..O6 . 2.59 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
同上，要检测F原子和氧原子之间的距离
不行的话就上数据
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3楼2020-12-08 11:31:44
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cyg801116

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by grenemal at 2020-12-08 11:31:44
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O3 ..O7 . 2.69 Ang.
x,y,z = 1_555 Check
PLAT430_ALERT_2_B Short Inter D...A Contact O4 ..O5 . 2.69 Ang.
-x,1-y,1-z = 3_566 Check
PLAT430_ALERT_2_B Shor ...

谢谢大侠。我把结构发给您，您给帮忙看看，再次感谢大侠
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4楼2020-12-08 22:21:04
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