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makotoichi

铜虫 (初入文坛)

[求助] pcr电泳弥散严重,求助大神是什么原因? 已有3人参与

跑的是环境样品里提的DNA,目的条带500bp上下,体系25uL

pcr电泳弥散严重,求助大神是什么原因?


@gyesang 发自小木虫Android客户端
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junjieshao

禁虫 (小有名气)

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2楼2020-12-04 04:15:19
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Alex998

新虫 (初入文坛)

同问,楼主解决问题了吗?
3楼2023-04-17 21:57:38
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KM石头

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Alex998 at 2023-04-17 21:57:38
同问,楼主解决问题了吗?

胶有问题,maker都没跑好,胶煮到没有颗粒,清澈透明才行
4楼2023-04-23 16:43:03
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poody

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

没有特异性带,可能是引物不够特异,重新设计引物;反应退火温度设置过低,调高退火温度;或者模板中目的序列拷贝数太低,试试多加点模板或是在采样时想办法提高浓度。
5楼2023-05-02 16:53:40
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ffplant

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

首先marker都不是很清晰,大概率是胶有问题或者是染料有问题,胶要煮沸才行,染料的话可以用新配的EB试试,没有EB就用最新的染料,染料放置时间过长也会出现这种情况,环境提取的DNA可能杂质较多,有些成分抑制了PCR,导致扩的效果不太好,建议做个模板量梯度试试,也可能是你的引物本身特异性不高,可以试试做个梯度PCR或降落PCR。
6楼2023-05-06 11:59:05
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