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机器猫123

银虫 (小有名气)

[求助] 晶体审稿意见求助 已有2人参与

最近投了配位化学,返回来的修稿意见,有一条关于氢键的问题,不知道该怎么修改,还请各位高手指点,请详细一些,谢谢各位!
Hydrogen atoms involved in traditional hydrogen bonds should have their positions refined.
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简单快乐,潇洒自在
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

涉及氢键的氢原子,位置没有精修?一般1.2或是1.5,复印哪几个氢原子的ins文件出来看看

发自小木虫Android客户端
2楼2020-11-22 23:04:59
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

这种问题应该是很好处理的

发自小木虫Android客户端
3楼2020-11-22 23:05:36
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机器猫123

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ljmmarise at 2020-11-22 23:05:36
这种问题应该是很好处理的

AFIX 3
H19A   2   0.266210  0.999923  0.237539 11.000000 -1.200000
AFIX 0
O18    4   0.085587  0.258496  0.732395 11.000000  0.157160  0.078060 =
           0.105750  0.052680 -0.098360 -0.057770
AFIX 3
H18A   2   0.173347  0.291756  0.796305 11.000000 -1.200000
H18B   2   0.107247  0.184246  0.770475 11.000000 -1.200000
AFIX 0
O17    4   0.354564  0.307241  0.461988 11.000000  0.036340
AFIX 3
H17A   2   0.369114  0.357631  0.412428 11.000000 -1.200000
H17B   2   0.290514  0.281431  0.412738 11.000000 -1.200000
AFIX 0
H19B   2   0.182046  0.893728  0.238941 11.000000 10.121000
HKLF 4
END  
是把H19B最后面那个数改成-1.200000就行吗?
还是把所有的氢最后八个数都改成-1.5
简单快乐,潇洒自在
4楼2020-11-23 17:09:19
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ljmmarise

至尊木虫 (著名写手)

把所有的氢最后八个数都改成-1.5

发自小木虫Android客户端
5楼2020-11-23 22:15:03
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mfdsrax2

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
AFIX 3是把氢原子固定住,不精修,这个不满足审稿人的要求。可以换成AFIX 5或者其他指令让氢原子参与精修
6楼2020-11-25 13:53:46
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

是不是把经典氢键涉及到的氢不用理论加氢,从Q峰里面指认出来,然后精修可以解决?
7楼2020-11-26 10:21:45
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