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lsq_phi木虫 (著名写手)
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【求助】【求助】输出出错
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新手求解：哪位能帮我看一下是什么问题？是计算机内存不够么？（前面有一步构型优化）分子是2-氰基呋喃。谢谢！ -------------------------------------------------- # B3LYP/6-311++g(3df,3pd) geom=allcheck guess=read -------------------------------------------------- Warning! SCF SP cutoffs with diffuse functions may be unreliable. Consider SCF=Tight 1/29=7,38=1/1; 2/40=1/2; 3/5=4,6=6,7=1616,11=2,16=1,25=1,30=1,74=-5/1,2,3; 4/5=1/1; 5/5=2,32=1,38=6/2; 6/7=2,8=2,9=2,10=2,28=1/1; 99/5=1,9=1/99; FileIO operation on non-existent file. FileIO: IOper= 2 IFilNo(1)=-20502 Len= 50 IPos= 20000 Q= 21128544 dumping /fiocom/, unit = 1 NFiles = 14 SizExt = 524288 WInBlk = 512 defal = T LstWrd = 826880 FType=2 FMxFil=10000 Number 0 501 502 598 989 991 992 993 Base 385536 303104 310784 333312 304128 307200 306688 302592 End 826880 304104 332834 333314 306628 310481 306693 302692 End1 826880 304128 333312 333824 306688 310784 307200 303104 Wr Pntr 385536 303104 310784 333312 304128 307200 306688 302592 Rd Pntr 385536 303104 310784 333312 304128 310481 306693 302692 Length 441344 1000 22050 2 2500 3281 5 100 Number 994 995 996 997 998 999 Base 20480 302080 21504 22016 20992 333824 End 20510 302090 21604 302022 21042 385076 End1 20992 302592 22016 302080 21504 385536 Wr Pntr 20480 302080 21504 22016 20992 333824 Rd Pntr 20510 302090 21604 302022 21042 335076 Length 30 10 100 280006 50 51252 dumping /fiocom/, unit = 2 NFiles = 1 SizExt = 0 WInBlk = 512 defal = F LstWrd = 66048 FType=2 FMxFil=10000 Number 0 Base 20480 End 66048 End1 66048 Wr Pntr 20480 Rd Pntr 20480 Length 45568 dumping /fiocom/, unit = 3 NFiles = 1 SizExt = 524288 WInBlk = 512 defal = T LstWrd = 66048 FType=2 FMxFil=10000 Number 0 Base 20480 End 66048 End1 66048 Wr Pntr 20480 Rd Pntr 20480 Length 45568 Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO. |
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跨磁盘分割scratch 文件 对于在两个或更多磁盘（或文件系统中）上分割读写文件，积分文件，和/或积分导数文件，提供了可选的语法。下面是%RWF命令的语法： %RWF=loc1,size1,loc2,size2,… 其中的每个loc是目录位置或文件路径名，每一个size是该目录中文件片段的最大尺寸。 Gaussian将对任何定义目录的loc自动产生唯一的文件名。在UNIX系统中，目录说明（不包含文件名）必须在末尾包含斜线“/”。 默认的尺寸以字节为单位；数值后可以接KB，MB或GB（中间不插入空格）分别表示KB， MB或GB，或接KW，MW或GW，分别表示千位，兆位或吉位。注意1 MB=10242位=1,048,576位（而不是1,000,000位）。 值-1接任何尺寸参数表示使用所有可用的空间，0值表示使用当前磁盘分区的空间。-1 仅对最后指定的文件是有用的，在这种情况下是默认的。 例如，下面的指令把读写文件分割到三个磁盘中： %RWF=/Dalton/s0/,60MW,/scratch/,800MB,/temp/s0/my_job,-1 文件片段的最大尺寸分别是480 MB，800 MB，和无限制。Gaussian将对前两个片段产生文件名，第三个的名称给定为my_job。注意目录说明的末尾包含斜线。 由于目前UNIX设备的限制，使用-1需要当心，因为它可能把一个文件片段延伸，超过系统所有剩余的磁盘空间；它的另一个作用是防止使用保存在列表中的任何附加的文件片段。 |
6楼2009-07-23 09:01:32
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对了，你是不是在命令行中用了restart了？ 下面是gaussian官网的论坛的帖子 Quote: Error termination in NtrErr: NtrErr Called from FileIO. This could mean various things, I had it once when I tried an invalid calculation but it could also mean that you're out of disk space (i.e. check wether you have a disk quota on the machine and where it puts its temporary files). Maybe you also want a bit more options with your command. At least add the word "Test" behind it, so that all the data on the calculation will not be stored. also a "maxcyc" keyword will help you contain your calculation if it decides to run out of hand. A good book to start with is "Exploring chemistry with electronic structure models" by James B. Foresman and Aeleen Frisch (Gaussian inc.) You may also want to check the gaussian site itself, since it contains an extensive help on how to correctly use commands. 你应该提供更多信息来让大家帮你，比如输入文件的全文 |
8楼2009-07-23 09:12:00
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非常感谢！下面是输入文件 %chk=C6H60 SMF H 6-311G B3LYP # opt=(calcall,maxcycle=110) freq b3lyp/6-311g(d,p) geom=connectivity C6H60 SMF H 6-311G B3LYP 0 1 C C 1 B1 C 2 B2 1 A1 C 3 B3 2 A2 1 D1 O 4 B4 3 A3 2 D2 H 2 B5 1 A4 5 D3 H 3 B6 2 A5 1 D4 H 4 B7 3 A6 2 D5 C 1 B8 2 A7 3 D6 C 9 B9 1 A8 2 D7 H 9 B10 1 A9 2 D8 H 10 B11 9 A10 1 D9 H 10 B12 9 A11 1 D10 B1 1.37958200 B2 1.44803021 B3 1.37969346 B4 1.39528573 B5 1.08579142 B6 1.08574477 B7 1.08539313 B8 1.54000000 B9 1.32591600 B10 1.09826310 B11 1.09826653 B12 1.09826310 A1 106.64330099 A2 106.58795128 A3 110.12347002 A4 127.73516782 A5 125.64408678 A6 135.43587107 A7 135.46441067 A8 122.71594253 A9 114.56607753 A10 122.71594252 A11 122.71797992 D1 -0.00385648 D2 -0.00336134 D3 -179.99730139 D4 -180.00000000 D5 -180.00000000 D6 180.00000000 D7 -180.00000000 D8 0.00000000 D9 -180.00000000 D10 0.00000000 1 2 2.0 5 1.0 9 1.0 2 3 1.0 6 1.0 3 4 2.0 7 1.0 4 5 1.0 8 1.0 5 6 7 8 9 10 2.0 11 1.0 10 12 1.0 13 1.0 11 12 13 --Link1-- %chk=C6H6O SMF H 6-311G B3LYP # b3lyp/6-311++g(3df,3pd) geom=allcheck guess=read C6H6O SMF H 6-311G B3LYP 0 1 |
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