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香辣糖醋肉

铜虫 (小有名气)

[求助] B类错误解决!!!! 已有1人参与

最近解析晶体时遇到如下错误,不知怎么解决,请论坛里的各位大神帮帮忙!问题如下:
PLAT201_ALERT_2_B Isotropic non-H Atoms in Main Residue(s) ....... 8 Report
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D H14B ..H18A . 1.89 Ang.
x,y,-1+z = 1_554 Check
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D H14B ..H18B . 2.09 Ang.
x,y,-1+z = 1_554 Check
PLAT417_ALERT_2_B Short Inter D-H..H-D H16A ..H18A . 2.01 Ang.
2-x,1-y,1-z = 2_766 Check
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O18 --H18B . Please Check
PLAT245_ALERT_2_B U(iso) H18A Smaller than U(eq) O18 by 0.092 Ang
这几个O是配位水或者游离水,请问大家,这类问题要怎么继续精修或者投稿时怎么解释
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wgfz1979

铜虫 (正式写手)


这类问题,我以前得花一星期解决,现在半天就可以了。解析小窍门很多,需要慢慢琢磨。
3楼2020-10-20 16:17:11
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河1234

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
香辣糖醋肉: 金币+10, 有帮助 2020-10-26 08:36:14
有些非氢原子没有进行各向异性精修。
氢键太短,重新加氢或者用dfix 限制、

建议重新加氢然后生成cif
crystal dream
4楼2020-10-21 11:06:49
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香辣糖醋肉

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by SAFEEEE at 2020-10-20 11:18:53
不断调节H的方向

好的,谢谢
5楼2020-10-26 08:14:04
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香辣糖醋肉

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wgfz1979 at 2020-10-20 16:17:11
这类问题,我以前得花一星期解决,现在半天就可以了。解析小窍门很多,需要慢慢琢磨。

你好,想请教一下,417,420错误都已经解决,只剩245的错误PLAT245_ALERT_2_B U(iso) H18A Smaller than U(eq) O18 by 0.092 Ang
这个问题具体怎么解决呢
6楼2020-10-26 08:15:47
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