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zhangh1985

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[交流] 【求助】beilstein数据库导出的sd（sdf）文件

我在beilstein数据库中搜索分子后，导出了sd文件，可查看时都是二维平面分子，请问各位大虾，有没有什么办法直接导出三维的sd文件？谢谢！！！

[ Last edited by zeoliters on 2009-11-15 at 22:54 ]

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1楼 2009-07-22 09:07:42

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zhangh1985

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引用回帖:

Originally posted by wsq402 at 2009-7-23 09:18:
Beilsteincrossfire commander只能导出2D结构式，如果要3D的，就需要从dicoverygate上下载，不过诸如MDDR以及ACD的3D结构，也基本是软件转过来的。如果有2D结构式，且有转换软件，你可以自己转换成2D

您好，我不知道discoverygate是什么啊，是不是Elsevier有关啊，如果是Elsevier 里的东西，我是不是需要一个一个的输入化合物名找到3D结构再保存为sd文件呢？我试过openbabel这个转换软件，将2D结构转换为3D结构后发现还是有错误，是不是本来是2D的结构的，如果不指明其它条件，会不会软件自动转变为稳定构型，而不管化合物本身的R或S构型了呢？谢谢！