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iPharmA

新虫 (初入文坛)

[交流] 硕士读计算机辅助药物设计需要什么准备工作已有4人参与

需不需要学编程,还是先学理论知识,看几本书?好迷茫,不知如何入手。

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ding_xy

至尊木虫 (著名写手)


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暂时不需要学编程,可以先根据老师实验室实际用的软件学一下如何开展具体操作和实验设计(论坛里有几款软件,如DS/Autodock等);另外需要看一些相关文献,重温一下药物化学中的构效关系。
2楼2020-10-15 08:19:56
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ding_xy

至尊木虫 (著名写手)


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引用回帖:
4楼: Originally posted by laji2012 at 2020-10-20 09:42:53
我想自学药物化学,有好的意见吗?能推荐几款免费的药物设计的软件吗?我原来做药物合成的,现在在环保局上班...

说起来,我可能都不算入门。
药物设计的软件,一般都是根据你要研究的靶点结构(蛋白--三维结构)设计化合物结构,通过计算机的对接模拟候选化合物(根据空间结构和药物化学知识设计的结构)的活性;软件预测结果只能是最初步的筛选或判断,合成候选化合物后,需要通过细胞/体外药理毒理试验,初步确认活性;然后根据结果开展结构优化等一系列筛选与测试,直到得到满意的结果。
个人建议,既然你已经在环保局工作了,就不要尝试药物设计的软件了;药物化学可以自学,有《药物化学》书籍、课件、视频等,都可以作为教材,多看药物结构与靶点的结合特点、药物活性、毒性、半衰期等指标,再结合电负性等化学知识可能会对药物化学学习有帮助。
5楼2020-10-20 16:19:59
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