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newbieworm

铜虫 (初入文坛)

[交流] 构建系统发育树遇到的问题

请教高人:本人想要构建某一菌株的系统发育树,将该菌株序列同网上下载的相近菌株序列先做成txt文档,再用ClustalX比对后保存aln文件。然后用MEGA转化为meg格式,打开该转化文档时发生错误:Error#4526:Invalid base found:* (in line313)。请问该怎么解决。
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newbieworm

铜虫 (初入文坛)

可是txt文档怎么转化fasta文档?MEGA也可以Agliment吗,命令在哪项菜单下面?
3楼2009-07-20 15:45:45
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weilin2378

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
newbieworm(金币+3,VIP+0):不够详细,操作性不强,不过还是多谢 7-20 16:32
应该将序列保存成Fasta格式,然后利用MEGA进行clustal比对,然后导出成MEGA格式,进而构建phylogenetic tree
2楼2009-07-20 15:34:39
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newbieworm

铜虫 (初入文坛)

在网上找了些教程跟着重新做了下,问题解决了,和二楼的方法大致相同。
所以多谢了,金币双手奉上
4楼2009-07-20 16:31:15
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