24小时热门版块排行榜    

查看: 526  |  回复: 3
当前主题已经存档。

newbieworm

铜虫 (初入文坛)

[交流] 构建系统发育树遇到的问题

请教高人:本人想要构建某一菌株的系统发育树,将该菌株序列同网上下载的相近菌株序列先做成txt文档,再用ClustalX比对后保存aln文件。然后用MEGA转化为meg格式,打开该转化文档时发生错误:Error#4526:Invalid base found:* (in line313)。请问该怎么解决。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

weilin2378

木虫 (小有名气)

★ ★ ★
newbieworm(金币+3,VIP+0):不够详细,操作性不强,不过还是多谢 7-20 16:32
应该将序列保存成Fasta格式,然后利用MEGA进行clustal比对,然后导出成MEGA格式,进而构建phylogenetic tree
2楼2009-07-20 15:34:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

newbieworm

铜虫 (初入文坛)

可是txt文档怎么转化fasta文档?MEGA也可以Agliment吗,命令在哪项菜单下面?
3楼2009-07-20 15:45:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

newbieworm

铜虫 (初入文坛)

在网上找了些教程跟着重新做了下,问题解决了,和二楼的方法大致相同。
所以多谢了,金币双手奉上
4楼2009-07-20 16:31:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 newbieworm 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +5 zju2000 2026-08-16 5/250 2026-08-16 23:23 by Haru815
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +32 医学老男孩 2026-08-13 74/3700 2026-08-16 21:05 by 医学老男孩
[论文投稿] 岩土工程学报什么时候才能终审完呐 25+3 yeager111 2026-08-10 4/200 2026-08-16 20:42 by tfang
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +13 archvillain 2026-08-15 25/1250 2026-08-16 20:13 by zhaosm1982
[基金申请] 2027广东省杰青 +3 奶牛小黑 2026-08-15 6/300 2026-08-16 20:07 by 奶牛小黑
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +9 Ldrop2023 2026-08-13 9/450 2026-08-16 13:24 by wukun_007
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 26/1300 2026-08-16 12:35 by 启萌科技
[基金申请] 我的国基提前知道中了,可是同事的操作让我实在接受不了,怎么会有这样的人 +11 家与远方 2026-08-10 16/800 2026-08-16 10:28 by ray43
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 是这周出结果还是下周出结果? +4 yuleib84 2026-08-11 4/200 2026-08-14 23:05 by lfy8008
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 帮忙看看fileCode +7 wwncly 2026-08-10 13/650 2026-08-11 19:36 by 冰心玉壶晴
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 国自然结果 +4 Vierhys 2026-08-10 8/400 2026-08-10 15:06 by Vierhys
[基金申请] 据悉今年马上要出结果了 +7 瞬息宇宙 2026-08-10 8/400 2026-08-10 12:42 by Vivilian
信息提示
请填处理意见