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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 自由基吸附
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douliguang

银虫 (正式写手)

[求助] 自由基吸附

请问各路大神，MS构建CH2-自由基在Co表面吸附过程，直接绘制CH2-就可以吗
如果是离子呢，怎么表示带电荷量
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1楼 2020-09-08 12:06:17
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l量子晓忆

铁虫 (职业作家)
用VASP算，改INCAR计算参数，能量用化学反应推导，

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2楼2020-09-08 13:39:06
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douliguang

银虫 (正式写手)
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2楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2020-09-08 13:39:06
用VASP算，改INCAR计算参数，能量用化学反应推导，

即使用VASP也需要初始的建模，一般用MS，如何在M中表示离子，比如K+，谢谢
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3楼2020-09-09 15:25:58
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l量子晓忆

铁虫 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by douliguang at 2020-09-09 15:25:58
即使用VASP也需要初始的建模，一般用MS，如何在M中表示离子，比如K+，谢谢...

一般金属离子直接放原子吸附即可，如果非要考虑电荷，在INCAR中4设置参数NELECT，调节体系所带电荷，

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4楼2020-09-10 16:32:39
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douliguang

银虫 (正式写手)
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4楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2020-09-10 16:32:39
一般金属离子直接放原子吸附即可，如果非要考虑电荷，在INCAR中4设置参数NELECT，调节体系所带电荷，
...

谢谢指导！
这个调节体系所带电荷是整个模型的还是K原子的，比如charege =1，是不是表示K带一个负电荷呢，那正电荷呢？
如果是体系总电荷没有什么太大意义
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5楼2020-09-10 16:54:17
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l量子晓忆

铁虫 (职业作家)
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5楼: Originally posted by douliguang at 2020-09-10 16:54:17
谢谢指导！
这个调节体系所带电荷是整个模型的还是K原子的，比如charege =1，是不是表示K带一个负电荷呢，那正电荷呢？
如果是体系总电荷没有什么太大意义...

总电荷，我知道的是只能考虑体系带的电荷，离子直接当原子加上就可以了，

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6楼2020-09-10 17:58:04
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douliguang

银虫 (正式写手)
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6楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2020-09-10 17:58:04
总电荷，我知道的是只能考虑体系带的电荷，离子直接当原子加上就可以了，
...

谢谢解答，解开了一些疑惑！
这样说来，对于O（原子）、O-（氧负离子）或者O*（氧自由基）的吸附在MS建模中都以O原子的形式表示了，对吗，不用设置电荷量
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7楼2020-09-12 10:52:30
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l量子晓忆

铁虫 (职业作家)
引用回帖:
7楼: Originally posted by douliguang at 2020-09-12 10:52:30
谢谢解答，解开了一些疑惑！
这样说来，对于O（原子）、O-（氧负离子）或者O*（氧自由基）的吸附在MS建模中都以O原子的形式表示了，对吗，不用设置电荷量...

是的，有Binding energy可以代表电荷影响，可以分析Bader charge得出电荷转移多少，就可以知道所带电荷。

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8楼2020-09-12 13:34:13
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douliguang

银虫 (正式写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2020-09-12 13:34:13
是的，有Binding energy可以代表电荷影响，可以分析Bader charge得出电荷转移多少，就可以知道所带电荷。
...

非常感谢！
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9楼2020-09-15 15:22:31
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