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douliguang

银虫 (正式写手)

[求助] 自由基吸附

请问各路大神,MS构建CH2-自由基在Co表面吸附过程,直接绘制CH2-就可以吗
如果是离子呢,怎么表示带电荷量
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l量子晓忆

铁虫 (职业作家)

用VASP算,改INCAR计算参数,能量用化学反应推导,

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2楼2020-09-08 13:39:06
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douliguang

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2020-09-08 13:39:06
用VASP算,改INCAR计算参数,能量用化学反应推导,

即使用VASP也需要初始的建模,一般用MS,如何在M中表示离子,比如K+,谢谢
3楼2020-09-09 15:25:58
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l量子晓忆

铁虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by douliguang at 2020-09-09 15:25:58
即使用VASP也需要初始的建模,一般用MS,如何在M中表示离子,比如K+,谢谢...

一般金属离子直接放原子吸附即可,如果非要考虑电荷,在INCAR中4设置参数NELECT,调节体系所带电荷,

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4楼2020-09-10 16:32:39
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douliguang

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2020-09-10 16:32:39
一般金属离子直接放原子吸附即可,如果非要考虑电荷,在INCAR中4设置参数NELECT,调节体系所带电荷,
...

谢谢指导!
这个调节体系所带电荷是整个模型的还是K原子的,比如charege =1,是不是表示K带一个负电荷呢,那正电荷呢?
如果是体系总电荷没有什么太大意义
5楼2020-09-10 16:54:17
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l量子晓忆

铁虫 (职业作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by douliguang at 2020-09-10 16:54:17
谢谢指导!
这个调节体系所带电荷是整个模型的还是K原子的,比如charege =1,是不是表示K带一个负电荷呢,那正电荷呢?
如果是体系总电荷没有什么太大意义...

总电荷,我知道的是只能考虑体系带的电荷,离子直接当原子加上就可以了,

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6楼2020-09-10 17:58:04
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douliguang

银虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2020-09-10 17:58:04
总电荷,我知道的是只能考虑体系带的电荷,离子直接当原子加上就可以了,
...

谢谢解答,解开了一些疑惑!
这样说来,对于O(原子)、O-(氧负离子)或者O*(氧自由基)的吸附在MS建模中都以O原子的形式表示了,对吗,不用设置电荷量
7楼2020-09-12 10:52:30
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l量子晓忆

铁虫 (职业作家)

引用回帖:
7楼: Originally posted by douliguang at 2020-09-12 10:52:30
谢谢解答,解开了一些疑惑!
这样说来,对于O(原子)、O-(氧负离子)或者O*(氧自由基)的吸附在MS建模中都以O原子的形式表示了,对吗,不用设置电荷量...

是的,有Binding energy可以代表电荷影响,可以分析Bader charge得出电荷转移多少,就可以知道所带电荷。

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8楼2020-09-12 13:34:13
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douliguang

银虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by l量子晓忆 at 2020-09-12 13:34:13
是的,有Binding energy可以代表电荷影响,可以分析Bader charge得出电荷转移多少,就可以知道所带电荷。
...

非常感谢!
9楼2020-09-15 15:22:31
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