24小时热门版块排行榜    

查看: 1171  |  回复: 2
【悬赏金币】回答本帖问题,作者849621108将赠送您 20 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

849621108

新虫 (小有名气)

[求助] QE-ralex计算耗时过高求助

各位老师好,本人用QE对Fe(110)表面吸附胆碱分子(共57个原子)进行优化耗时过高已算18小时(36核机子,指定24核进行计算)先前已搭建2层Fe(110)进行优化计算,5小时就能算完,结果收敛。不明白为什么加了几个分子就算的这么费劲了,还请大家帮忙分析指出问题
1. 输入文件是否需要修改,萌新一枚还需要多多学习
2. 关于K点的设置一直不明白该如何设置,本人只想优化后进行自洽计算,得到分子和表面的结合能
3. 看结果已经得到 !total energy =   ,为何又进行了几次计算,一直没结束   

输入文件如下:
&CONTROL
    calculation   = "relax"
    forc_conv_thr =  1.00000e-03
    max_seconds   =  1.72800e+05
    nstep         = 100
    outdir        = "./out/"
    prefix        = "Fe"
    pseudo_dir    = "./pseudo/"
/

&SYSTEM
    a                         =  8.54435e+00
    b                         =  1.20835e+01
    c                         =  2.20139e+01
    degauss                   =  1.00000e-02
    ecutrho                   =  7.20000e+02
    ecutwfc                   =  7.10000e+01
    ibrav                     = 8
    nat                       = 57
    nbnd                      = 560
    nspin                     = 2
    ntyp                      = 5
    occupations               = "smearing"
    smearing                  = "gaussian"
    starting_magnetization(1) =  2.00000e-01
/

&ELECTRONS
    conv_thr         =  1.00000e-06
    electron_maxstep = 200
    mixing_beta      =  4.00000e-01
    startingpot      = "atomic"
    startingwfc      = "atomic+random"
/

&IONS
    ion_dynamics = "bfgs"
/

&CELL
/

K_POINTS {gamma}

ATOMIC_SPECIES
Fe     55.84500  Fe.pbe-spn-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
C      12.01070  C.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
O      15.99940  O.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
H       1.00794  H.pbe-rrkjus_psl.1.0.0.UPF
N      14.00674  N.pbe-n-rrkjus_psl.1.0.0.UPF

ATOMIC_POSITIONS {angstrom}
Fe      1.424026   0.000000   3.199978
Fe      0.000000   2.013858   3.199969
Fe      0.000000   0.000000   1.281726  0 0 0
Fe      1.424058   2.013922   1.281726  0 0 0
Fe      1.424028   4.027940   3.199913
Fe      0.000000   6.041766   3.199919
Fe      0.000000   4.027844   1.281726  0 0 0
Fe      1.424058   6.041766   1.281726  0 0 0
Fe      1.424028   8.055592   3.199913
Fe      0.000000  10.069675   3.199969
Fe      0.000000   8.055688   1.281726  0 0 0
Fe      1.424058  10.069611   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   0.000000   3.199966
Fe      2.848090   2.013858   3.199947
Fe      2.848116   0.000000   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   2.013922   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   4.027940   3.199908
Fe      2.848090   6.041766   3.199903
Fe      2.848116   4.027844   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   6.041766   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174   8.055592   3.199908
Fe      2.848090  10.069675   3.199947
Fe      2.848116   8.055688   1.281726  0 0 0
Fe      4.272174  10.069611   1.281726  0 0 0
Fe      7.120322   0.000000   3.199978
Fe      5.696258   2.013858   3.199947
Fe      5.696232   0.000000   1.281726  0 0 0
Fe      7.120290   2.013922   1.281726  0 0 0
Fe      7.120320   4.027940   3.199913
Fe      5.696258   6.041766   3.199903
Fe      5.696232   4.027844   1.281726  0 0 0
Fe      7.120290   6.041766   1.281726  0 0 0
Fe      7.120320   8.055592   3.199913
Fe      5.696258  10.069675   3.199947
Fe      5.696232   8.055688   1.281726  0 0 0
Fe      7.120290  10.069611   1.281726  0 0 0
N       5.207106   6.379566   9.490652
C       4.458808   5.274458   8.788986
H       4.466925   5.504868   7.722789
H       5.027292   4.356460   8.939624
C       5.344448   6.105289  10.970915
H       5.871006   6.956905  11.405325
H       4.352568   6.009537  11.406872
H       5.934319   5.200383  11.106221
C       4.542290   7.719280   9.299953
H       3.583093   7.721465   9.812374
H       5.197316   8.476850   9.734927
H       4.399315   7.890241   8.233444
C       6.592575   6.454392   8.891952
H       6.498674   6.693765   7.833590
H       7.072934   5.487661   9.021847
H       7.378590   7.242216   9.160463
C       3.015406   5.040035   9.222742
H       2.962920   4.724101  10.270916
H       2.410084   5.946501   9.101761
O       2.572384   4.009714   8.353457
H       1.673974   3.758595   8.592521
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

akakcolin

金虫 (著名写手)

你的体系原子比较少,应该用较少的核,比如8核跑 就会快,猜测不一定对,您可以尝试下
为人应当诚实正直不能心怀叵测心眼明亮才能迎来幸福避开灾祸盲目者若有人指点才不会迷失道路若单独上路就难以保证不误入岐途
2楼2021-09-12 21:35:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 849621108 的主题更新
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 有化学投稿的期刊推荐吗 20+3 荣小撇 2024-06-13 3/150 2024-06-19 19:29 by 瓦列利安
[考博] 关于读博感觉自己很抓马 +8 小九月 2024-06-19 11/550 2024-06-19 19:22 by 鱼翔浅底1
[考博] 34岁读博士晚吗 +39 emitdne 2024-06-13 39/1950 2024-06-19 19:03 by Dqtjs
[基金申请] 75批博后基金 +11 kyukitu 2024-06-13 14/700 2024-06-19 18:44 by Siuhong Yiu
[访问学者] 国家公派访问学者申请结果出了吗? +4 65syn 2024-06-13 4/200 2024-06-19 16:40 by 海洋之心168
[基金申请] Nature 11日发文,中国著名学者们称造假迫不得已 +8 babu2015 2024-06-14 8/400 2024-06-19 15:25 by 风今25
[论文投稿] 求机械类四区sci推荐 5+4 迷茫小旷 2024-06-14 5/250 2024-06-19 14:08 by tangjie12345
[论文投稿] ACS AMI 返回审稿意见,一个大修,两个据稿,编辑给的修改重投 +5 智商已更新 2024-06-19 5/250 2024-06-19 12:35 by nono2009
[考博] 这个博士要读吗 +13 Sea Breeze 2024-06-16 22/1100 2024-06-19 10:05 by 牵着小猫跑步
[基金申请] 博后基金刷到的BUG,图片来的更直观 +15 carolloo 2024-06-17 16/800 2024-06-19 09:42 by msjy
[找工作] 初始合伙人来啦!(生物试剂耗材标准品) +14 欢快的小科研人 2024-06-15 25/1250 2024-06-18 20:35 by 小飞来虫
[基金申请] F口401需要啥文章水平 +3 lhjr123 2024-06-16 7/350 2024-06-18 16:05 by hon920603
[论文投稿] 投稿求助 10+3 2022_灵魂工程师 2024-06-16 8/400 2024-06-18 12:12 by 投必得科研顾问
[基金申请] 太卷了 +13 laoyuefubio 2024-06-17 26/1300 2024-06-18 10:56 by shuigubio
[催化] 镍负载氧化铝的保存问题 8+3 lwn0130 2024-06-15 4/200 2024-06-17 10:48 by adaihao
[论文投稿] 投稿时忘记修改一作 +7 gll123456 2024-06-13 11/550 2024-06-15 11:49 by gll123456
[基金申请] E12面上申请 +4 汉风之遗 2024-06-13 4/200 2024-06-14 15:28 by 天外飞去来
[考博] 申博找导师 +4 疏影横斜水清浅3 2024-06-13 6/300 2024-06-14 14:31 by zxl_1105
[基金申请] 工材E10口函评结束了吗 10+3 我1的飞翔 2024-06-13 5/250 2024-06-14 06:35 by nono2009
[论文投稿] 投稿后发现其他作者的邮箱填错了该怎么办呀 10+4 在飞的猪 2024-06-13 6/300 2024-06-14 04:45 by 小虫子咔咔
信息提示
请填处理意见