应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 做进化树前用BLAST下载序列的问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 897  |  回复: 2
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者贾立羽将赠送您 15 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

贾立羽

新虫 (初入文坛)

[求助] 做进化树前用BLAST下载序列的问题 已有1人参与

我用BLAST找到了相关序列以后打算下载然后做进化树，但是要下载这个蛋白的全部序列还是下载对比之后的aligned序列啊？如果下载aligned序列就会删掉一部分，但是下载全序列又有很多冗余的序列出现，所以到底用哪个做树才好一直不是很明白，有没有高人给讲解一下？生信小白，非常感谢！

做进化树前用BLAST下载序列的问题
如图
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2020-07-29 20:26:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

贾立羽

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 澄江 at 2020-07-30 10:58:38
我觉得比对好后的吧，你即使下全序列，构建进化树之前还需要比对，才能构建。最好两种都试下，看看有没有差别

如果不用全序列的话会去掉一大段的多余序列呀，我现在做的蛋白有的物种里长800aa有的长500aa，一下载aligned以后就会去掉两百多的长度，这个有什么影响吗
赞一下 回复此楼
3楼2020-07-31 09:10:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答

澄江

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我觉得比对好后的吧，你即使下全序列，构建进化树之前还需要比对，才能构建。最好两种都试下，看看有没有差别
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2020-07-30 10:58:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 3 个回答
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学求调剂 +4 起个名咋这么难 2026-03-27 4/200 2026-03-27 21:39 by 83503孙老师
[考研] 277跪求调剂 +5 1915668 2026-03-27 8/400 2026-03-27 19:53 by WYUMater
[考研] 食品工程专硕一志愿中海洋309求调剂 +3 小张zxy张 2026-03-26 5/250 2026-03-27 18:42 by 小张zxy张
[考研] 272求调剂 +7 脚滑的守法公民 2026-03-27 7/350 2026-03-27 17:23 by laoshidan
[考研] 299求调剂 +6 嗯嗯嗯嗯2 2026-03-27 6/300 2026-03-27 12:43 by 果果妈咪
[考研] 0703化学338求调剂！ +6 Zuhui0306 2026-03-26 7/350 2026-03-27 10:35 by shangxh
[考研] 材料学硕，求调剂 6+5 糖葫芦888ll 2026-03-22 10/500 2026-03-27 08:18 by hypershenger
[考研] 0703化学求调剂 +3 丹青奶盖 2026-03-26 5/250 2026-03-26 20:11 by macy2011
[考研] 271求调剂 +6 生如夏花… 2026-03-22 6/300 2026-03-26 16:48 by 张凯十八号
[考研] 281求调剂 +6 Koxui 2026-03-24 7/350 2026-03-26 15:37 by 无际的草原
[考研] 总分293求调剂 +6 加一一九 2026-03-25 8/400 2026-03-26 13:30 by yujianx
[考研] 一志愿南航 335分 | 0856材料化工 | GPA 4.07 | 有科研经历 +6 cccchenso 2026-03-23 6/300 2026-03-25 22:25 by 544594351
[考研] B区考研调剂 +4 yqdszhdap－ 2026-03-22 5/250 2026-03-25 08:51 by baoball
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +10 纸鱼ly 2026-03-21 11/550 2026-03-24 17:22 by qingfeng258
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
[考研] 一志愿山东大学药学学硕求调剂 +3 开开心心没烦恼 2026-03-23 4/200 2026-03-24 00:06 by 开开心心没烦恼
[考研] 341求调剂(一志愿湖南大学070300) +5 番茄头--- 2026-03-22 6/300 2026-03-23 23:45 by Txy@872106
[考研] 一志愿重庆大学085700资源与环境，总分308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-23 8/400 2026-03-23 20:36 by Creta
[考研] 石河子大学（211、双一流）硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭