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wangyinran金虫 (小有名气)
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求助单茂金属配合物的过渡态,茂环不旋转的问题 已有1人参与
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寻找烯烃配位到单茂金属配合物上的过渡态,由于茂环不是对称的,环戊二烯上取代了四个甲基和一个三甲基硅基,我在寻找过渡态时,看优化过程发现茂环并没有沿着茂环中点与中心金属的连线转动,尽管这样找出来的过渡态的振动方向和IRC都符合预期。但茂环的位置会影像能量计算,怎样才能找到最低点呢? 输入文件和输出文件已经提供。 求解该如何应对? |
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2020-07-17 16:30:17, 3.68 M
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wangyinran
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人为旋转过,能量确实有变化。具体为向左旋转90度,再计算过渡态,发现优化过程中茂环没有旋转,位阻会导致茂环上的取代基键角变化,能量增加了1.5kcal/mol。其他角度还没试。我不想人为地去一点点的调角度。 如何确定最低点?当前无法做刚性扫描,是因为需要在茂环中心设置一个虚原子,保存为内坐标后无法找到对应的二面角,在atom list里也无法将虚原子添加到我想要的二面角里。 发自小木虫Android客户端 |
3楼2020-07-18 01:02:44
paramecium86
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2楼2020-07-17 23:52:08
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4楼2020-07-18 01:23:04













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