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hufeilong1982

木虫 (正式写手)

[交流] 求助

PLAT601_ALERT_2_A Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .     257.00 A**3
这类错误怎么解决啊?
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)

★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
sanko211(金币+2,VIP+0):感谢热心的虫友,欢迎常来晶体版 7-15 11:33
有空腔
用platon处理一下
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
2楼2009-07-15 11:10:09
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hufeilong1982

木虫 (正式写手)

楼上的,具体是怎么处理啊 ?
3楼2009-07-15 14:38:52
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
squeeze一下
把生成的sqf中的一段文字拷到cif中
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
4楼2009-07-15 14:44:13
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yy0520yy

金虫 (职业作家)

学习了,没见过这种情况呢!
5楼2009-07-15 16:41:40
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hufeilong1982

木虫 (正式写手)

哈哈
谢谢
那squeeze掉后 溶剂分子不是没有了?
6楼2009-07-15 18:52:23
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腾龙云飞

金虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不会,溶剂分子还有
可以处理这个A级错误
但行好事 莫问前程 _______ 渤海之滨 黄河之津 书生侠骨 义薄惊云
7楼2009-07-15 19:58:13
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hufeilong1982

木虫 (正式写手)

谢谢

谢谢 腾龙云飞  

可以扣我5个金币给他吗?
8楼2009-07-16 08:07:13
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xi2004

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
waiy2001(金币+3,VIP+0):谢谢热心解答 7-16 13:35
建议还是想办法先从残余峰找找原子.
实在没办法了,才用Squeez.
xi2004-emuch@163.com
9楼2009-07-16 08:20:40
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hufeilong1982

木虫 (正式写手)

xi2004

xi2004 好
你的意思是q峰没有指认完?

squeeze后出现
Search for and Analysis of Solvent Accessible Voids in the Structure - Grid = 0.20 Ang., Probe Radius =  1.20 Ang., NStep = 6
====================================================================================================================================

van der Waals (or ion) Radii used in the Analysis
================================================================================
    C    H   Co    N    O    Q
--------------------------------------------------------------------------------
1.70 1.20 2.03 1.55 1.52 1.70

:: Grid: X-Axis Step = 0.0119 = Points  84, Angstrom Step = 0.21
:: Grid: Z-Axis Step = 0.0069 = Points 144, Angstrom Step = 0.20
:: Grid: Y-Axis Step = 0.0119 = Points  84, Angstrom Step = 0.21



:: Unit cell Contains NO Residual Solvent Accessible Void.

:: Note: use CALC VOID (not CALC SOLV) for Packing Index.

是什么 意思?
谢谢
10楼2009-07-16 08:23:13
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