应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 分类/鉴定 » 利用MEGA建立发育树，有几株目标菌株在树里总是没有相似序列
51/1返回列表
查看: 1586  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
【悬赏金币】回答本帖问题，作者Herrix将赠送您 5 个金币

Herrix

新虫 (初入文坛)

[求助] 利用MEGA建立发育树，有几株目标菌株在树里总是没有相似序列 已有2人参与

目标菌株N3 N12 N13 N14这几个总是游离在外，不管如何增删序列，求助如何解决这个问题

利用MEGA建立发育树，有几株目标菌株在树里总是没有相似序列


发自小木虫Android客户端
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2020-07-15 10:56:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

给你的温柔

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
我认为你建树的挑的序列有问题。如果你这些菌株不是同一种菌，应该分别建树，每一棵树，用的都是同一种菌的序列。在一棵树上把多种菌都列出来，我是没见过。你在知网上搜一下“16S 分离鉴定”，基本上出来的文章里都有建树，自己分析以下每一个研究者建树所选择的序列。如有误，请大家批评指正。
赞一下 回复此楼
fighting!
2楼2020-07-16 19:40:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Zzz睡觉

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你可以检查下用的序列，是否“反向互补了”。我之前做分类的时候，就是因为公司返给我的测序数据是反向互补的，建树就一直游离在外面。如果没有反向互补，建议到NCBI上进行blast，确定是哪个属，以防材料被污染。
赞一下 回复此楼
3楼2020-07-17 14:43:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Herrix

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Zzz睡觉 at 2020-07-17 14:43:09
你可以检查下用的序列，是否“反向互补了”。我之前做分类的时候，就是因为公司返给我的测序数据是反向互补的，建树就一直游离在外面。如果没有反向互补，建议到NCBI上进行blast，确定是哪个属，以防材料被污染。

就是反向互补的问题！替换成互补序列之后就可以了

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
4楼2020-07-18 10:40:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Herrix

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 给你的温柔 at 2020-07-16 19:40:07
我认为你建树的挑的序列有问题。如果你这些菌株不是同一种菌，应该分别建树，每一棵树，用的都是同一种菌的序列。在一棵树上把多种菌都列出来，我是没见过。你在知网上搜一下“16S 分离鉴定”，基本上出来的文章里都 ...

感谢指导！

发自小木虫Android客户端
回复此楼
5楼2020-07-18 10:43:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Herrix 的主题更新
51/1返回列表
不应助 确定回帖应助 (注意：应助才可能被奖励，但不允许灌水，必须填写15个字符以上)
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 4/200 2026-11-01 20:08 by xzcv0Tehd8lQ
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 20:03 by xzcv0Tehd8lQ
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 19:50 by xzcv0Tehd8lQ
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 19:50 by xzcv0Tehd8lQ
[博后之家] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 8/400 2026-11-01 16:58 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 7/350 2026-11-01 16:58 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 X5bHxOULxFqb 2026-10-30 22/1100 2026-11-01 16:35 by BCdvBAEpt3zm
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 7/350 2026-11-01 15:08 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 6/300 2026-11-01 15:04 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 9/450 2026-11-01 14:55 by BCdvBAEpt3zm
[论文投稿] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 xvJS1BYDxvBS 2026-10-31 7/350 2026-11-01 14:50 by BCdvBAEpt3zm
[考研] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 14:37 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 越来越担心硕士毕业后没有竞争力了 +9 zuesli 2026-10-27 15/750 2026-11-01 12:59 by Equinoxhua
[考博] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-31 6/300 2026-11-01 12:40 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 7/350 2026-11-01 12:27 by BCdvBAEpt3zm
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 11/550 2026-11-01 12:24 by BCdvBAEpt3zm
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 13/650 2026-11-01 12:14 by BCdvBAEpt3zm
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 hKe7U1kad5Sg 2026-10-31 5/250 2026-11-01 11:14 by BCdvBAEpt3zm
[博后之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 1uaZt2kAZj2S 2026-10-30 15/750 2026-11-01 05:22 by YXM1FDCSE8Bn
[考博] 2027博士申请-临床检验诊断学、病原生物学、微生物方向 50+3 yyh@ 2026-10-28 4/200 2026-10-31 12:47 by 可淡不可忘
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭