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[交流] 泛癌基因家族分析(泛癌多基因的药物敏感性分析)

泛癌基因家族分析(泛癌多基因的药物敏感性分析)
                                                                                             --生信自学网
      今天我们给大家讲解下泛癌基因家族分析(泛癌多基因文章套路)，这个目前比较热的一个课题。基因家族（gene family），是指来源于同一个祖先，由一个基因通过基因重复而产生两个或更多的拷贝而构成的一组基因，它们在结构和功能上具有明显的相似性，编码相似的蛋白质产物。在泛癌的背景下，加上基因家族的分析，就形成了多癌种多基因的文章套路。泛癌基因家族分析将多个癌症中的多个基因进行联合分析，观察家族中的基因在正常和肿瘤的差异情况，以及基因与生存、肿瘤微环境、肿瘤干细胞的相关性分析。同时，我们找出基因的改变与药物敏感性的关系。
      课程内容包括：泛癌多基因文章套路，软件准备，泛癌数据下载，id转换，提取目标基因，泛癌基因表达水平，泛癌差异分析，泛癌差异分析热图，基因相关性分析，生存分析输入文件，生存分析KM，COX分析，免疫亚型分析，肿瘤微环境，肿瘤微环境相关性，肿瘤干细胞相关性（RNAss），肿瘤干细胞相关性（DNAss），药物敏感性，单肿瘤免疫亚型相关性，单肿瘤临床相关性，单肿瘤微环境和干细胞指数。

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