24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2000  |  回复: 5
【悬赏金币】回答本帖问题,作者天天ttgg将赠送您 15 个金币
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

天天ttgg

新虫 (初入文坛)

[求助] lamp引物序列本身的特异性怎么分析已有1人参与

怎么在NCBI或者其他软件上分析LAMP引物序列本身的特异性?

发自小木虫Android客户端
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

科研上岸马

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Creek0501 at 2020-08-12 17:25:35
可以Bowtie比对一下

bowtie可以针对FIP/BIP进行直接分析吗?FIP/BIP的设计不是通过2段接到一起的吗?还是说需要分开进行单独分析?
4楼2020-12-02 17:43:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

匿名

本帖仅楼主可见
2楼2020-08-10 22:49:49
已阅   申请MolEPI   回复此楼   编辑   查看我的主页

Creek0501

铜虫 (初入文坛)

可以Bowtie比对一下
3楼2020-08-12 17:25:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

科研上岸马

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我对于FIP/BIP是采用就是设计的时候接起来的方法把它单独分开来,通过NCBI的Primer Blast的里面进行一个nr的blast,然后看引物的单独的特异性好不好。因为LAMP是2对引物共同作用,如果引物只要有一个存在问题,那么扩增就会存在很大问题,所以说从引物的作用角度来分析我觉得好像特异性蛮高。但是容易出现假阳性扩增,这点是不是又可以说引物本身特异性不好?

还希望有大佬看到给我个回复,小弟才初入LAMP,很多东西还不是很懂~~
5楼2020-12-02 17:46:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
不应助 确定回帖应助 (注意:应助才可能被奖励,但不允许灌水,必须填写15个字符以上)
信息提示
请填处理意见