24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 2525  |  回复: 17
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

longyun80

木虫 (小有名气)

[交流] 【求助】GV输出的Oniom输入文件如何修改已有4人参与

进行oniom的时候的输入文件时用GV直接生成的,请问哪些地方需要修改呢?生成文件如下,谢谢!
%chk=******
%mem=6MW
%nprocshared=1
# opt=maxcycle=200 oniom(b3lyp/6-31g(d):uff) geom=connectivity

Picture 1

0 1 0 2 0 2
O-O_R           -1   10.02050000   11.24840000   -9.22310000 L
O-O_2            0   10.02050000   11.24840000    3.91890000 H
O-O_2           -1   10.06950000    8.48960000   -3.91890000 L
O-O_2            0   12.30490000   11.33510000    2.61790000 H
O-O_2           -1    7.78510000    8.40290000   -2.61790000 L
O-O_R           -1   12.06450000   12.56510000   -8.21510000 L
O-O_2            0   12.06450000   12.56510000    4.92690000 H
O-O_2            0   12.10990000    9.93650000    4.82840000 H
O-O_2           -1    7.98010000    9.80150000   -4.82840000 L
O-O_2           -1   13.48080000   10.62920000    0.36530000 L
O-O_2           -1    6.60920000    9.10880000   -0.36530000 L
O-O_2           -1   13.46610000    8.99080000    2.42470000 L
O-O_2           -1    6.62390000   10.74720000   -2.42470000 L
O-O_2           -1   14.92530000   11.17730000    2.48910000 L
O-O_2           -1    4.88030000   11.17730000    4.08190000 L
O-O_2           -1   14.24350000   12.42660000   -1.39310000 L
O-O_2           -1    4.19850000   12.42660000   -5.17790000 L
O-O_2           -1   16.00310000   10.76650000   -0.36140000 L
O-O_2           -1    5.95810000   10.76650000   -6.20960000 L
O-O_2           -1   14.19200000    9.88830000   -2.05540000 L
O-O_2           -1    5.89800000    9.84970000    2.05540000 L
O-O_2           -1    7.88570000   12.36640000   -5.41060000 L
O-O_2           -1    8.34550000   10.59910000   -7.30300000 L
O-O_2           -1    8.34550000   10.59910000    5.83900000 L
O-O_2           -1   12.65930000    8.32700000   -3.50890000 L
O-O_2           -1    7.43070000   11.41100000    3.50890000 L
O-O_2           -1   11.50790000   10.67980000   -3.72180000 L
O-O_2           -1    8.58210000    9.05820000    3.72180000 L
O-O_2           -1    5.62330000   12.46030000    1.91350000 L
O-O_2           -1    9.86600000   16.87200000   -3.72050000 L
O-O_2           -1    9.86600000   12.73500000   -3.72050000 L
O-O_2           -1    7.39520000   16.40460000   -2.96610000 L
O-O_2           -1    7.39520000   13.20240000   -2.96610000 L
O-O_2           -1    8.56380000   14.80350000   -4.69040000 L
O-O_2           -1    6.46330000   16.99610000   -0.57690000 L
O-O_2           -1   16.50830000   12.61090000   -5.99410000 L
O-O_2           -1    6.46330000   12.61090000   -0.57690000 L
O-O_2           -1   14.88720000   12.66750000   -3.92950000 L
O-O_2           -1    4.84220000   12.66750000   -2.64150000 L
O-O_2           -1    5.91270000   14.80350000    0.76090000 L
O-O_2           -1   14.01420000   13.19880000   -6.57490000 L
O-O_2           -1    3.96920000   13.19880000    0.00390000 L
O-O_2           -1   11.94930000   14.80350000   -6.84040000 L
O-O_2           -1   11.66970000   12.49410000   -5.61820000 L
O-O_2           -1   11.66970000   17.11290000   -5.61820000 L
O-O_2           -1   12.40910000   13.08680000   -3.16200000 L
O-O_2           -1   12.40910000   16.52020000   -3.16200000 L
O-O_2           -1   14.29620000   14.80350000   -2.51410000 L
Si-             -1   11.62430000   11.27250000   -9.06540000 L
Al-Al3           0   11.62430000   11.27250000    4.07660000 H
Si-Si3          -1    8.46570000    8.46550000   -4.07660000 L
Si-Si3          -1   13.54210000   10.53280000    1.97130000 L H-H_ 4
Si-Si3          -1    3.49710000   10.53280000    4.59970000 L
Si-Si3          -1    6.54790000    9.20520000   -1.97130000 L
Si-Si3          -1   14.48140000   10.92670000   -0.86080000 L
Si-Si3          -1    4.43640000   10.92670000   -5.71020000 L
Si-Si3          -1    5.60860000    8.81130000    0.86080000 L
Si-Si3          -1   12.54770000    8.85460000    5.93890000 L H-H_ 8
Si-Si3          -1   17.58730000   10.88340000   -0.63210000 L
Si-Si3          -1    7.54230000   10.88340000   -5.93890000 L
Si-Si3          -1    7.54230000   10.88340000    7.20310000 L
Si-Si3          -1   11.49310000    9.15820000   -4.24880000 L
Si-Si3          -1    8.59690000   10.57980000   -8.89320000 L
Si-Si3          -1    8.59690000   10.57980000    4.24880000 L H-H_ 2
Si-Si3          -1   14.13190000    8.51250000   -2.88730000 L
Si-Si3          -1   16.00310000   11.22550000    3.68370000 L
Si-Si3          -1    5.95810000   11.22550000    2.88730000 L
Si-Si3          -1    8.42760000   16.33110000   -4.19890000 L
Si-Si3          -1    8.42760000   13.27590000   -4.19890000 L
Si-Si3          -1    6.33210000   17.30090000   -2.15400000 L
Si-Si3          -1   16.37710000   12.30610000   -4.41700000 L
Si-Si3          -1   13.75790000    7.43190000    2.15400000 L
Si-Si3          -1    6.33210000   12.30610000   -2.15400000 L
Si-Si3          -1    5.49090000   16.33950000    0.52830000 L
Si-Si3          -1   15.53590000   13.26750000   -7.09930000 L
Si-Si3          -1    5.49090000   13.26750000    0.52830000 L
Si-Si3          -1   12.42630000   13.26630000   -6.81150000 L
Si-Si3          -1   12.42630000   13.26630000    6.33050000 L H-H_ 7
Si-Si3          -1   12.42630000   16.34070000   -6.81150000 L
Si-Si3          -1    2.38130000   13.26630000    0.24050000 L
Si-Si3          -1   11.36440000   12.24950000   -4.05690000 L
Si-Si3          -1   11.36440000   17.35750000   -4.05690000 L
Si-Si3          -1    8.72560000    7.48850000    4.05690000 L
Si-Si3          -1   13.95660000   13.24820000   -2.74930000 L
Si-Si3          -1   13.95660000   16.35880000   -2.74930000 L
Si-Si3          -1    3.91160000   13.24820000   -3.82170000 L

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-11-13 at 15:28 ]
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wqmartin

木虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
送鲜花一朵
今天又看了一下帖子,特别感谢yjcmwgk 版主对ONIOM的详细说明!
16楼2011-11-25 10:57:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

王中学

木虫 (正式写手)

海边拾贝的顽童

★ ★
longyun80(金币+1):谢谢参与
gwdavid(金币+1,VIP+0):谢谢! 7-14 10:50
一般分子坐标部分不需要改,只是内存和路径可能要改
君当如兰,幽谷长风,宁静志远
2楼2009-07-14 09:48:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZDBWHZ

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
longyun80(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-9 22:36
由于氧的电负性比较大建议在优化的时候基组6-31g(d)变为6-31+g(d)。
3楼2009-08-09 21:33:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ZDBWHZ

金虫 (正式写手)

★ ★
lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 8-9 22:36
建议不使用关键词geom=connectivity,因为这没什么用。
4楼2009-08-09 21:34:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见