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shipoche

金虫 (小有名气)

[求助] 分子对接蛋白建模求助 已有1人参与

请问各位大佬,当我们做分子对接没有现成蛋白晶体结构时,通常是选用同源建模(大部分文献都是),那为什么不用穿线法建模呢?这个问题困惑了我好久,希望大家能解惑,谢谢
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cngdkpmg

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

如果能找到序列一致性较高的蛋白模板,当然用同源模建。就算现在有了AlphaFold2,还是同源模建更好。毕竟,普遍来说,穿线法和de novo预测都不如来自晶体结构的数据更准确,尤其是局部细节的处理,这对分子对接来说又尤其重要。

希望能帮到你
2楼2021-11-26 18:56:01
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