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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » 分子动力学计算均方回转半径
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这只小铆锚

新虫 (小有名气)

[交流] 分子动力学计算均方回转半径 已有3人参与

跑分子动力学计算均方回转半径的时候，跑的步长足够长，但是均方回转半径就是不能稳定在一个值左右，计算平均值也不符合与链长0.6的标度指数。链长越长，偏差越大。（链长分子数20-120）这是为什么。
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1楼 2020-05-27 21:04:30
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1262166712

铜虫 (小有名气)
★
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引用回帖:
6楼: Originally posted by 这只小铆锚 at 2021-03-13 10:41:27
这个问题去年已经解决了，突然想起来就回来记录一下。我的计算是正确的，但是取样有问题。
1. 当时没有意识到采样间隔对结果的影响，间隔设置太小，相当于一会儿看一下一会儿看一下，它当然是在剧烈波动的（不波动 ...

你好，请教一下，如何测得聚合物的均方末端距和回转半径
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7楼2022-02-16 14:03:17
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一顿吃伍两

金虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
确定分析程序没错吗？确定的话到也没问题，我以前算的也是偏差很大，结合结构看一看

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2楼2020-05-27 21:19:35
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hdx1991

新虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
回旋半径的定义不是半径

发自小木虫Android客户端
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3楼2020-05-28 00:35:23
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这只小铆锚

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 一顿吃伍两 at 2020-05-27 21:19:35
确定分析程序没错吗？确定的话到也没问题，我以前算的也是偏差很大，结合结构看一看

数值不稳定很有可能是取样的问题，解决之后它依旧不符合 Rg~链长^3/5 的标度关系，我很困惑。三维自由空间模拟真实链，Zimm模型。
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4楼2020-05-29 18:13:57
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