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chemstudent

木虫 (小有名气)

[求助] YASARA对接-受体蛋白准备已有1人参与

从PDB下载了一个蛋白结构,但是PDB文件的蛋白结构本身含有小分子配体,我准备对接一个其他的小分子,请教各位大神,原来这个配体怎么去掉,是直接delete吗?还是要设置一些参数呢?谢谢
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痴槑

新虫 (初入文坛)

第一:可以下载PyMol软件,里面可以去除蛋白质的水分子、配体,教程网上都有;
第二:分子对接软件AutoDock也可以去除配体。
第三:B站上有很多这样的视频。
2楼2020-05-28 10:15:52
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