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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

[交流] 【求助】怎样算离子有机分子与大分子的绑定能?(跑完动力学后)

比如算小蛋白与苯酚负离子的。

[ Last edited by lei0736 on 2009-11-25 at 12:24 ]
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人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
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qixingbao07

木虫 (正式写手)

没做过,期待高手
2楼2009-07-11 08:55:31
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

同期待
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
3楼2009-07-11 10:43:09
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qixingbao07

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 7-15 11:59
calculate binding energy 试试,它在receptor-ligand interaction
4楼2009-07-15 08:28:26
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 7-27 10:18
不可以的,可以老早算了。
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
5楼2009-07-17 08:33:04
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童心

木虫 (正式写手)

★ ★
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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 8-21 09:24
引用回帖:
Originally posted by qixingbao07 at 2009-7-15 08:28:
calculate binding energy 试试,它在receptor-ligand interaction

就是这样计算的呀,楼主有没有把参数设定正确呢?
6楼2009-07-23 08:41:57
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

我是做的similation里的MM/PBSA,输入小分子是负离子就不好做。
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
7楼2009-08-18 19:45:33
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guoyingnba

金虫 (小有名气)

★ ★
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lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 8-21 09:24
计算结合能,calculate binding energy 我也是用这个做的,不知道你为什么说不可以。
8楼2009-08-21 08:24:39
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yyx19840628

木虫 (著名写手)

鹰的眼睛,狼的耳朵,豹的速 ...

小分子和负离子不可以。系统提示出错
人生的最大遗憾莫过于错误地坚持了不该坚持的,轻易地放弃了不该放弃的……
9楼2009-09-05 11:24:51
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