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xiao2008zhu

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于过渡态优化

在做过渡态的时候,都要优化反应物、过渡态和产物,可是有个问题,就是过渡态是一个能量最大点,要是进行优化,怎么可能会稳定呢?还有就是在两个反应物,不可能放的很远,可是优化以后,会离的特别远,这怎么办呢?
我以前是做MS,感觉优化就是找能量小点、稳定点。
请高手指教。非常感谢。
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

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lei0736(金币+5,VIP+0):谢谢 7-10 10:05
你问了三个问题,我依次回答吧。
(1)在做过渡态的时候,都要优化反应物、过渡态和产物,可是有个问题,就是过渡态是一个能量最大点,要是进行优化,怎么可能会稳定呢?
过渡态当然不是稳定点。谁告诉你优化就一定是找能量最小点?如果优化就一定是找能量最小点,那么过渡态怎么能找到呢?
(2)还有就是在两个反应物,不可能放的很远,可是优化以后,会离的特别远,这怎么办呢?
这两个反应物,你放置的位置不好,无法反应,斥力很大,所以优化之后就分开很远了。你好好调整下你的反应物的相对位置,让它们能顺利反应下去。
(3)我以前是做MS,感觉优化就是找能量小点、稳定点。
即使是用MS,MS也有TS计算,MS里面的TS计算也并不是找能量最小点啊。

最后加一条:你做过渡态计算,找的是在反应方向的能量最大点,而非最小点
建议你看看高斯说明书中的opt关键字中ts,qst2,qst3,calcfc,calcall这几个选项的解释
2楼2009-07-09 21:47:45
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xiao2008zhu

银虫 (小有名气)

谢谢楼上的,那优化是什么意思呢?在MS里对某一结构进行几何优化,不就是找一个这个结构的一个能量的最小点么?

而对于过渡态的优化是什么样的优化么?优化的标准是什么呢?

[ Last edited by xiao2008zhu on 2009-7-9 at 22:18 ]
3楼2009-07-09 22:08:23
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xiao2008zhu

银虫 (小有名气)

再次请教。

过渡态是TS搜索出来的,那优化了以后,构型不就变了么?那要怎么办?
还有,就是优化过渡态,优化前后的构型会不会变化很大呢?
4楼2009-07-10 10:18:02
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recoli

金虫 (正式写手)

★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-10 13:39
过渡态搜索=过渡态优化,一般用关键字Opt的TS或QST2或QST3选项来实现。这个是寻找能量最大点的算法。

一般说的优化是寻找能量最小点的算法。
5楼2009-07-10 13:06:34
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yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-10 16:40
过渡态应该是一个鞍点吧,在某方向上为最大值点,而在另一方向上为最小值点。
6楼2009-07-10 13:49:46
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xiao2008zhu

银虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by recoli at 2009-7-10 13:06:
过渡态搜索=过渡态优化,一般用关键字Opt的TS或QST2或QST3选项来实现。这个是寻找能量最大点的算法。

一般说的优化是寻找能量最小点的算法。

谢谢了,那反应物优化、产物优化是一般意义的优化么?即能量最小点?
7楼2009-07-10 17:13:00
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poppyly

铁虫 (小有名气)

★ ★ ★
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lei0736(金币+2,VIP+0):谢谢 7-13 14:46
优化指找能量的最低点,结构最稳定。
过渡态是在一维势能面是能量最低点,其他势能面是最高点
8楼2009-07-13 10:45:57
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