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poppyly

铁虫 (小有名气)

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[交流] 【分享】Gaussian 09新增的功能

Gaussian 09增加的功能：

能量和求导
(1) 最近发展的半经验模型（AM1，PM3，PM3MM，PDDG，PM6），计算解析一阶导和二阶导，用户自定义参数，以及结合使用PCM溶剂模型。
(2) TDDFT解析梯度和数值频率。
(3) EOM-CCSD计算激发能。
(4) 新的DFT泛函，包括HSE，wB97，m05/m06，LC类泛函，以及双杂化B2PLYP。
(5) 经验离散模型和相应的泛函。
(6) ROMP3，ROMP4，ROCCSD，ROCCSD(T)能量。
(7) W1RO，W1BD，G4方法计算能量。
(8) DFTB半经验模型，以及使用解析矩阵元的DFTBA版本。

ONIOM
(1) ONIOM与PCM组合。有多种ONIOM+PCM模型。
(2) ONIOM计算IRC，即使分子包含上千个原子效率也很高。

溶剂化
(1) 新的PCM溶剂化算法，使能量成为核坐标的连续函数。现在，PCM的几何优化与气相优化的收敛速度一样。
(2) 特定态的自洽溶剂化，用于模拟荧光和其它发射过程。它对上百种溶剂进行了参数化，可以给出非常好的总溶剂化自由能。

几何优化和IRC
(1) 能量最小化默认使用GEDIIS几何优化算法，这对大的柔软分子特别有帮助。
(2) 对最小值和过渡结构使用二次收敛ONIOM(MO:MM)优化，既用于力学部分，也用于电子嵌入部分。
(3) 一个输入部分，用于控制优化中的冻结或非冻结原子。可以用原子、元素、残基、或ONIOM层来指定原子。

分子特性
(1) 解析的含频ROA强度。
(2) 解析的DFT 超极化率。
(3) 使用两个态的谐振模式，通过Franck-Condon原理计算电子激发、发射、光电离的谱带带型。
(4) 用Herzberg-Teller或Franck-Condon-Herzberg-Teller理论计算电子激发的谱带带型。
(5) 选择简正模式用于显示，非谐校正，和FC/HT/FCHT分析。可通过原子、元素、残基、或ONIOM层来选择。

分析和输出
(1) 蛋白质二级结构的信息可以包含在分子指定输入部分，或者.fchk文件中。
(2) 轨道布居分析，给出原子或角动量对轨道的贡献。
(3) 正则UHF/UDFT进行二次正交化，用于显示或用于ROHF计算的初始猜测。
(4) CIS和TD激发的自然跃迁轨道分析。
(5) 把占据轨道投影到最小基之后，进行Mulliken布居分析。当基组增大时，这能给出稳定的布居。

其它新功能
(1) SCF的初始猜测可以从片段计算的组合产生，需要指定每个片段的电荷和自旋。
(2) 用四点差分而不是默认的两点差分计算数值频率，具有更高的精度和数值稳定性。

效率改善
(1) HF和DFT对大分子的频率计算更快，特别是当并行时。
(2) FMM以及线性标度的库仑和交换对簇并行。
(3) 大体系的ONIOM(MO:MM)频率计算更快，特别是对电子嵌入。可以计算100-200 QM原子和6000 MM原子的频率。
(4) 在大型频率计算中保存简正模式，用于显示或打印模式，以及开始IRC=RCFC任务。
(5) CC，BD，和EOM-CCSD振幅可以保存在检查点文件中，在以后的计算中读入。保存BD轨道并在以后读入。
(6) 半经验，HF，和DFT的频率计算可以在中期计算中重新开始。
(7) CC和EOM-CC计算可以在中期计算中重新开始。
(8) ONIOM各步的初始猜测可以来自不同的检查点文件。
(9) 加入了SVP，TZVP，QZV基组的密度拟合基。Fit关键字调用与AO基组匹配的拟合基，没有特定的拟合基时需要Auto关键字。
(10)在Default.Route文件中包含DensityFit关键字，只要执行纯密度泛函就使用拟合。
(11)为了与文献发表的基组兼容，读入的密度拟合因子可以是非归一化的原函数，密度归一化的原函数，或归一化的原函数。

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1楼 2009-07-09 15:08:12

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引用回帖:

Originally posted by beefly at 2009-7-9 23:10:

呵呵，你们现在用的g03可不可以低价转售啊？好多人买不起正版啊。

实验仪器是可以卖二手的，不知道软件行不行。gaussian公司会不会疯掉？

[ Last edited by beefly on 2009-7-9 at 23:11 ]

哈哈，你这想法太有意思了，人家Gaussian公司才是版本的知识产权人，咱们没有权利转卖别人的东西，这样是犯法的

不过我觉得我们学校的老师都觉得gaussian 很便宜呢，比起MS便宜多了