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poppyly

铁虫 (小有名气)

[交流] 【分享】Gaussian 09新增的功能

Gaussian 09增加的功能:

能量和求导
(1) 最近发展的半经验模型(AM1,PM3,PM3MM,PDDG,PM6),计算解析一阶导和二阶导,用户自定义参数,以及结合使用PCM溶剂模型。
(2) TDDFT解析梯度和数值频率。
(3) EOM-CCSD计算激发能。
(4) 新的DFT泛函,包括HSE,wB97,m05/m06,LC类泛函,以及双杂化B2PLYP。
(5) 经验离散模型和相应的泛函。
(6) ROMP3,ROMP4,ROCCSD,ROCCSD(T)能量。
(7) W1RO,W1BD,G4方法计算能量。
(8) DFTB半经验模型,以及使用解析矩阵元的DFTBA版本。


ONIOM
(1) ONIOM与PCM组合。有多种ONIOM+PCM模型。
(2) ONIOM计算IRC,即使分子包含上千个原子效率也很高。


溶剂化
(1) 新的PCM溶剂化算法,使能量成为核坐标的连续函数。现在,PCM的几何优化与气相优化的收敛速度一样。
(2) 特定态的自洽溶剂化,用于模拟荧光和其它发射过程。它对上百种溶剂进行了参数化,可以给出非常好的总溶剂化自由能。


几何优化和IRC
(1) 能量最小化默认使用GEDIIS几何优化算法,这对大的柔软分子特别有帮助。
(2) 对最小值和过渡结构使用二次收敛ONIOM(MO:MM)优化,既用于力学部分,也用于电子嵌入部分。
(3) 一个输入部分,用于控制优化中的冻结或非冻结原子。可以用原子、元素、残基、或ONIOM层来指定原子。


分子特性
(1) 解析的含频ROA强度。
(2) 解析的DFT 超极化率。
(3) 使用两个态的谐振模式,通过Franck-Condon原理计算电子激发、发射、光电离的谱带带型。
(4) 用Herzberg-Teller或Franck-Condon-Herzberg-Teller理论计算电子激发的谱带带型。
(5) 选择简正模式用于显示,非谐校正,和FC/HT/FCHT分析。可通过原子、元素、残基、或ONIOM层来选择。


分析和输出
(1) 蛋白质二级结构的信息可以包含在分子指定输入部分,或者.fchk文件中。
(2) 轨道布居分析,给出原子或角动量对轨道的贡献。
(3) 正则UHF/UDFT进行二次正交化,用于显示或用于ROHF计算的初始猜测。
(4) CIS和TD激发的自然跃迁轨道分析。
(5) 把占据轨道投影到最小基之后,进行Mulliken布居分析。当基组增大时,这能给出稳定的布居。


其它新功能
(1) SCF的初始猜测可以从片段计算的组合产生,需要指定每个片段的电荷和自旋。
(2) 用四点差分而不是默认的两点差分计算数值频率,具有更高的精度和数值稳定性。


效率改善
(1) HF和DFT对大分子的频率计算更快,特别是当并行时。
(2) FMM以及线性标度的库仑和交换对簇并行。
(3) 大体系的ONIOM(MO:MM)频率计算更快,特别是对电子嵌入。可以计算100-200 QM原子和6000 MM原子的频率。
(4) 在大型频率计算中保存简正模式,用于显示或打印模式,以及开始IRC=RCFC任务。
(5) CC,BD,和EOM-CCSD振幅可以保存在检查点文件中,在以后的计算中读入。保存BD轨道并在以后读入。
(6) 半经验,HF,和DFT的频率计算可以在中期计算中重新开始。
(7) CC和EOM-CC计算可以在中期计算中重新开始。
(8) ONIOM各步的初始猜测可以来自不同的检查点文件。
(9) 加入了SVP,TZVP,QZV基组的密度拟合基。Fit关键字调用与AO基组匹配的拟合基,没有特定的拟合基时需要Auto关键字。
(10)在Default.Route文件中包含DensityFit关键字,只要执行纯密度泛函就使用拟合。
(11)为了与文献发表的基组兼容,读入的密度拟合因子可以是非归一化的原函数,密度归一化的原函数,或归一化的原函数。
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recoli

金虫 (正式写手)


lei0736(金币+1,VIP+0):谢谢 7-10 10:02
PCM算法有大改进啊!
2楼2009-07-09 17:05:53
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szmeng

至尊木虫 (文坛精英)

说服老板,高斯升级。
3楼2009-07-09 20:54:24
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by szmeng at 2009-7-9 20:54:
说服老板,高斯升级。

呵呵,你们现在用的g03可不可以低价转售啊?好多人买不起正版啊。

实验仪器是可以卖二手的,不知道软件行不行。gaussian公司会不会疯掉?

[ Last edited by beefly on 2009-7-9 at 23:11 ]
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
4楼2009-07-09 23:10:30
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poppyly

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by beefly at 2009-7-9 23:10:


呵呵,你们现在用的g03可不可以低价转售啊?好多人买不起正版啊。

实验仪器是可以卖二手的,不知道软件行不行。gaussian公司会不会疯掉?

[ Last edited by beefly on 2009-7-9 at 23:11 ]

哈哈,你这想法太有意思了,人家Gaussian公司才是版本的知识产权人,咱们没有权利转卖别人的东西,这样是犯法的

不过我觉得我们学校的老师都觉得gaussian 很便宜呢,比起MS便宜多了
5楼2009-07-10 09:10:01
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)

谁告你软件不能卖二手?买卖的都是使用权,跟知识产权有啥关系。
6楼2009-07-10 12:38:17
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poppyly

铁虫 (小有名气)

软件又不是你开发的,你没有资格卖使用权
7楼2009-07-10 12:39:41
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Jasminer

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
软件又不是渠道商开发的,同理,他们也没有资格卖使用权
8楼2009-07-10 12:42:27
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poppyly

铁虫 (小有名气)

拜托什么叫授权呢,不给你吵了,没意思,

俺还是科研吧
9楼2009-07-10 14:39:32
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