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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

[求助] rRNA用什么算法建分子进化树?

我现在要通过rRNA序列分析同属昆虫各种的亲缘关系。
1)用什么算法及参数进行alignment合适?
2)因为是非蛋白质基因,序列中间的gap为正常突变,用什么算法及参数建树合适?
3)关于gap的pairwise deletion、partial deletion、complete deletion分别是什么算法?
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sadam

银虫 (小有名气)

2楼2020-05-02 10:29:31
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

引用回帖:
2楼: Originally posted by sadam at 2020-05-02 10:29:31
看文献

有好的文献推荐吗
3楼2020-05-02 13:11:45
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sadam

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2020-05-02 13:11:45
有好的文献推荐吗

自己搜
4楼2020-05-02 16:50:46
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