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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » rRNA用什么算法建分子进化树？
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)

[求助] rRNA用什么算法建分子进化树？

我现在要通过rRNA序列分析同属昆虫各种的亲缘关系。
1）用什么算法及参数进行alignment合适？
2）因为是非蛋白质基因，序列中间的gap为正常突变，用什么算法及参数建树合适？
3）关于gap的pairwise deletion、partial deletion、complete deletion分别是什么算法？
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1楼 2020-05-01 21:06:49
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sadam

银虫 (小有名气)
看文献
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2楼2020-05-02 10:29:31
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jurkat.1640

至尊木虫 (文坛精英)
引用回帖:
2楼: Originally posted by sadam at 2020-05-02 10:29:31
看文献

有好的文献推荐吗
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3楼2020-05-02 13:11:45
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sadam

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by jurkat.1640 at 2020-05-02 13:11:45
有好的文献推荐吗

自己搜
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4楼2020-05-02 16:50:46
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