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Wistal

铁虫 (初入文坛)

[求助] 请问如何使用三代测序的参考基因组序列

手里有一批二代双端测序的数据,看到最新报道的三代测序参考序列,想重新比对一下。因为实验物种是双倍体。
问一下有人做过这个吗?
使用HISAT2进行mapping的时候是使用primary config 还是也考虑等位基因?
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Creek0501

铜虫 (初入文坛)

比对的目的是什么?想解决一个什么生物学问题?
2楼2020-04-28 09:23:15
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Wistal

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Creek0501 at 2020-04-28 09:23:15
比对的目的是什么?想解决一个什么生物学问题?

就是作为转录组数据的参考序列
3楼2020-05-02 16:12:29
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